相关原理详细介绍生信技能树详解GSEA[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAx...[作者空间]
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转录因子分析的流程 一、从转录因子数据库下载大麦转录因子CDS序列 PlantTFDB - Plant Trans...[作者空间]
转录因子 (transcription factors, TFs) 是直接作用于基因组,与特定DNA序列结合 (T...[作者空间]
本节概览1. WGCNA基本概念:定义、关键术语、基本流程、一些注意事项2. WGCNA运行:⓪输入数据准备①判断...[作者空间]
前言:进行RNA-seq入门实战首先需要有一定的linux与R基础,推荐跟着B站生信技能树-jimmy老师学习打牢...[作者空间]
在RNA-seq或芯片数据下游分析中经常遇到需要将基因表达矩阵行名的ensembl_id ( gene_id ) ...[作者空间]
(五)比对相关 blast:Basic Local Alignment Search Tool,一种序列比对的工具...[作者空间]
基因集功能富集分析 一组基因直接注释的结果是得到大量的功能结点。这些功能具有概念上的交叠现象,导致分析结果冗余,不...[作者空间]
原创 如期生物 常规基因表达量qPCR检测,首要的是设计一对特异的检测引物,下边如期生物以人的“FAU1”基因为例...[作者空间]
做可变剪切分析时,会依次进行基因水平和转录本水平的差异分析,最后通常需要进行ENSEMBL ID和 transcr...[作者空间]
前言 做RNAseq有半年了,最近比较有时间,所以想把流程记录一下。并且搞清楚很多知其然而不知其所以然的细节步骤。...[作者空间]
三个常用参考基因组数据库: Ensembl:www.ensembl.org[http://www.ensembl....[作者空间]
以前写过不少零散的 RNA-Seq 分析文章,现在整理为流程,同时修改一些错误。流程包含质控、比对、定量、差异分析...[作者空间]
全网最全 GO 注释结果绘图,直击 SCI 绘图标注,关注我,您最好的选择! 前言 1. GO 原理 基因组测序已...[作者空间]
Pfam数据库中,提供了以下3个不同层级蛋白质家族信息。1.family(每个family以PF编号唯一标识,所有...[作者空间]
1. 细菌 Cas9 的原理 (1) 原始状态 (2) 改造后的状态 (3) 如何编辑 genomic DNA 其...[作者空间]
1.数据下载 下载流程之前写过,参考就可以。知道GSE号如何从GEO下载sra数据 - 简书 (jianshu.c...[作者空间]
本文是由比利时列日大学Marc HANIKENNE课程整理。陆陆续续花费1个月完成,根据需要做的主要内容分为四个部...[作者空间]
今天和大家聊一聊共线性分析。 共线性 共线性研究的是同源基因或者序列的排布关系,比较常见的是组装基因组文章中,通过...[作者空间]