刘小泽写于19.2.15先来看一个例子 如果得到的表达矩阵如下: 发现: gene1在低抗样本中的表达量在50左右...[作者空间]
刘小泽写于19.2.13做无参真的需要比有参更多的耐心啊 假设现在对两组样本进行转录组测序,得到5个基因(每条基因...[作者空间]
感谢公众号关注:oddxix有问题,欢迎后台提出 RNA-seq实验流程 总RNA提取 得到样品后需要进行样品检测...[作者空间]
原文来自这里,略编辑 摘要 简单且高效地分析RNA测序数据的能力是Bioconductor的核心优势。 RNA-s...[作者空间]
1. 转录组数据统计推断的难题 在RNA-seq中进行两组间的差异分析是最正常不过的了。 我们在其它实验中同样会遇...[作者空间]
RNA-seq的数据分析是比较简单基础的分析,大概流程就是处理下机的fastq数据(trimmomatic),比对...[作者空间]
欢迎关注:oddxix 有问题,欢迎后台沟通 概念 广义:转录组(transcriptome)是特定细胞在某一功能...[作者空间]
写在前面: 1某些富集代码 |关于GSEA|某些主流富集分析工具 两类富集分析 A:差异基因富集分析(不需要...[作者空间]
欢迎关注”生信修炼手册”! 本文采用WGCNA官网的Tutirial 1的数据,对加权基因共表达网络分析和后续的数...[作者空间]
欢迎关注”生信修炼手册”! 共表达基因指的是表达量具有协同变化趋势的基因集合,通常认为这些基因参与相同的生物学过程...[作者空间]
欢迎关注”生信修炼手册”! WGCNA是目前非常火热的一项研究内容,其全称为weighted correlatio...[作者空间]
欢迎关注”生信修炼手册”! Gene Set Enrichment Analysis是一种富集算法,由Broad ...[作者空间]
话休絮烦 主要流程: 将reads比对到基因组上; 将比对好的reads进行拼装; 量化基因的表达水平; 计算在不...[作者空间]
上周,我们分享了用RPKM值计算差异基因的方法,这周我们继续分享另外一种方法p-value。 我们都知道,在利用R...[作者空间]
刘小泽写于18.11.12 半年之前我和花花成立了“生信星球”,转眼过得好快,我们每天都能和爱生信的小伙伴们交流,...[作者空间]
最重要的参考链接 https://pmbio.org/course/#module-06-rnaseq githu...[作者空间]
RNAseq测序reads定位 获得RNA-seq的原始数据后,首先需要将所有测序读段通过序列映射(mapping...[作者空间]
网站:https://sourceforge.net/projects/apatrap/ 1.fatsq的QC 2...[作者空间]
想做好RNA-seq?你得先搞定它! 来源: 发表日期:2018-01-10 浏览量:391 前言 近年来,随着二...[作者空间]
低丰度也意味着可靠性低,所以就算是差异大,也不会有太高的置信度 1) 低表达量的基因为什么往往差异不显著; 1)提...[作者空间]