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    Genomics

    • 根据基因名称批量提取基因序列
      0
      2021-08-01
    • 根据基因名称批量提取基因序列实验中经常需要从基因组中提取、序列用于设计引物,或者进行基因功能研究等,之前看到别人使用的一个脚本,自己拿来用一下...[作者空间]

    • OrthoMCL及orthofinder 两种软件进行聚类分析
      0
      2021-05-21
    • OrthoMCL及orthofinder 两种软件进行聚类分析OrthoMCL介绍 1. OrthoMCL的用途 基于序列的相似性,OrthoMCL能将一组proteins(比...[作者空间]

    • Tools:seqkit快速多线程全平台fastq处理工具
      0
      2021-03-15
    • Tools:seqkit快速多线程全平台fastq处理工具seqkit的使用方法[https://bioinf.shenwei.me/seqkit/]seqkit gith...[作者空间]

    • 蛋白质组学数据库
      0
      2021-01-31
    • 蛋白质组学数据库https://www.uniprot.org/[https://www.uniprot.org/] 1.UniP...[作者空间]

    • 【陪你学·生信】十二、RNA相关的简单分析
      0
      2021-01-06
    • 【陪你学·生信】十二、RNA相关的简单分析​本章将介绍一些极简单的RNA生信分析,如利用在线网站预测RNA分子二级结构,分析非编码RNA(non-codin...[作者空间]

    • samtools常用命令
      0
      2020-12-16
    • samtools常用命令1. view Usage: samtools view [options] | [region1 [...]...[作者空间]

    • 基因结构注释(4):整合预测结果
      0
      2020-12-15
    • 基因结构注释(4):整合预测结果参考链接 如何对基因组进行注释[https://www.jianshu.com/p/931e9821c45a] 从...[作者空间]

    • 工具 | SignalP 3.0 使用
      0
      2020-12-14
    • 工具 | SignalP 3.0 使用安装 下载安装包 - SignalP 3.0: Linux[https://services.healthtech...[作者空间]

    • 基因家族共线性分析
      0
      2020-12-09
    • 基因家族共线性分析共线性分析 mcscan共线性分析1[https://www.jianshu.com/p/4b1b14f8c4c4...[作者空间]

    • [比较基因组] 基因家族聚类(orthovenn2)
      0
      2020-12-07
    • [比较基因组] 基因家族聚类(orthovenn2)orthovenn2[https://orthovenn2.bioinfotoolkits.net/home]im...[作者空间]

    • 根据.gff注释文件和基因组(.fna)提取目标区域序列并计算G
      0
      2020-12-06
    • 根据.gff注释文件和基因组(.fna)提取目标区域序列并计算G这几天需要做八十多个种的比较基因组,网上找了半天没有提取intron(内含子区)和intergenic regio...[作者空间]

    • 经典:基因组测序数据从头拼接或组装算法的原理
      0
      2020-10-29
    • 经典:基因组测序数据从头拼接或组装算法的原理原作者:https://www.cnblogs.com/aipufu/p/11596253.html https:...[作者空间]

    • LTR组装指数(LAI)评估基因组
      0
      2020-10-22
    • LTR组装指数(LAI)评估基因组基因组组装完成后,可通过查看contig的N50或者BUSCO,以及LAI评估组装质量。本文就LAI方法做一简单介...[作者空间]

    • 全基因组测序分析流程
      0
      2020-10-18
    • 全基因组测序分析流程全代码 各部分细节一、准备工作 二、下载文件(如果是自己测得数据,可以直接将数据放到fastq文件夹中即可) 三、...[作者空间]

    • 基因在染色体上位置可视化
      0
      2020-10-15
    • 基因在染色体上位置可视化感谢CJ大神的反复修改,这个功能越变越好了!本文旨在复现CJ大神推文内容,具体请参考“省心炸鸡”,手动狗头(htt...[作者空间]

    • 基因组共线用MCScanX
      0
      2020-09-15
    • 基因组共线用MCScanX导读 下载、安装、使用MCScanX分析NCBI taxonomy上下载的两个梭菌基因组共线性情况。共线性又称同线...[作者空间]

    • 构建本地化Blast2GO数据库
      0
      2020-08-06
    • 构建本地化Blast2GO数据库一、背景说明 Blast2GO官方提供的在线版本,第一速度非常慢,第二不利于我们提交后台进行大规模地对各种物种进行...[作者空间]

    • ANI AAI TETRA Mash比较基因组
      0
      2020-07-27
    • ANI AAI TETRA Mash比较基因组导读 比较平均核酸一致性average nucleotide identity(ANI)和氨基酸一致性amino ...[作者空间]

    • 2020-07-25全基因组重测序基础及高级分析知识汇总
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      2020-07-25
    • 2020-07-25全基因组重测序基础及高级分析知识汇总转载自:http://www.360doc.com/content/18/0208/11/19913717_728...[作者空间]

    • 在R中利用fasta序列构建进化树
      0
      2020-07-14
    • 在R中利用fasta序列构建进化树“进化树的构建怎么操作?”“那肯定是用MEGA啊!” 可是真的好麻烦啊,要先比对再建树,然后再进行各种美化,习惯了...[作者空间]

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