实验中经常需要从基因组中提取、序列用于设计引物,或者进行基因功能研究等,之前看到别人使用的一个脚本,自己拿来用一下...[作者空间]
OrthoMCL介绍 1. OrthoMCL的用途 基于序列的相似性,OrthoMCL能将一组proteins(比...[作者空间]
seqkit的使用方法[https://bioinf.shenwei.me/seqkit/]seqkit gith...[作者空间]
https://www.uniprot.org/[https://www.uniprot.org/] 1.UniP...[作者空间]
本章将介绍一些极简单的RNA生信分析,如利用在线网站预测RNA分子二级结构,分析非编码RNA(non-codin...[作者空间]
1. view Usage: samtools view [options] | [region1 [...]...[作者空间]
参考链接 如何对基因组进行注释[https://www.jianshu.com/p/931e9821c45a] 从...[作者空间]
安装 下载安装包 - SignalP 3.0: Linux[https://services.healthtech...[作者空间]
共线性分析 mcscan共线性分析1[https://www.jianshu.com/p/4b1b14f8c4c4...[作者空间]
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这几天需要做八十多个种的比较基因组,网上找了半天没有提取intron(内含子区)和intergenic regio...[作者空间]
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基因组组装完成后,可通过查看contig的N50或者BUSCO,以及LAI评估组装质量。本文就LAI方法做一简单介...[作者空间]
全代码 各部分细节一、准备工作 二、下载文件(如果是自己测得数据,可以直接将数据放到fastq文件夹中即可) 三、...[作者空间]
感谢CJ大神的反复修改,这个功能越变越好了!本文旨在复现CJ大神推文内容,具体请参考“省心炸鸡”,手动狗头(htt...[作者空间]
导读 下载、安装、使用MCScanX分析NCBI taxonomy上下载的两个梭菌基因组共线性情况。共线性又称同线...[作者空间]
一、背景说明 Blast2GO官方提供的在线版本,第一速度非常慢,第二不利于我们提交后台进行大规模地对各种物种进行...[作者空间]
导读 比较平均核酸一致性average nucleotide identity(ANI)和氨基酸一致性amino ...[作者空间]
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“进化树的构建怎么操作?”“那肯定是用MEGA啊!” 可是真的好麻烦啊,要先比对再建树,然后再进行各种美化,习惯了...[作者空间]