此款软件是基于SNP位点进行群体结构的推断,运行速度比较快一些,本文主要介绍它的详细安装步骤。一、安装fastSt...[作者空间]
小虎编辑可能会迟到,但是永远不会缺席。 因为最近忙于科研,没有那么多空闲的时间写推送,所以鸽了一段时间。不过,作为...[作者空间]
R作图-使用circlize绘制样本物种丰度关联弦状图 circlize图也即是弦图能较好展示样本物种丰度关联关系...[作者空间]
文章题目 Chloroplot: An Online Program for the versatile plot...[作者空间]
'patchwork:合并多个R图的包' patchwork是基于gglot2的拼图包,它使得基于ggplot2的...[作者空间]
Hello,小伙伴们,大家好! 还在为CG View Server,GeneWiz browser等网...[作者空间]
写在前面:在上亿年的进化历程中,基因组经历了大大小小的改变。从小的核苷酸突变、插入、缺失到大的基因缺失、重复、基因...[作者空间]
MECAT2是三代测序数据PacBio的高效组装工具,是之前MECAT的改进版, 修复了之前的很多bug, 使用基...[作者空间]
在高通量测序数据的处理中(例如,在重测序研究、组装结果的re-mapping校正中),我们经常会将测序reads与...[作者空间]
Annals of Oncology 26: 64–70, 2015doi:10.1093/annonc/mdu4...[作者空间]
简介: https://www.nature.com/articles/s41592-020-0748-5 htt...[作者空间]
maftools_2 clp 02 June, 2020 maftools : 总结、分析、可视化 MAF文件ma...[作者空间]
最近发现了python版的MCScan,是个大宝藏。由于走了不少弯路,终于画出美图,赶紧记录下来。github地址...[作者空间]
目前已发表的用于挖掘Bt毒力因子基因的软件有两个:一个是本课题组发表于2012年的网页版工具BtToxin_Sca...[作者空间]
最近打算开始写一个多组学(包括宏基因组/16S/转录组/蛋白组/代谢组)关联分析的R包,避免重复造轮子,在开始之前...[作者空间]
今天我们介绍一款全平台可以使用的多序列比对工具,那就是Jalview,它的功能非常强大,但是我们今天讲解最基本的多...[作者空间]
刘小乐老师课题组发布了一个用于预测差异表达或共表达基因集的转录调控子的工具Lisa文章为:《Lisa: infer...[作者空间]
在做motif分析时,经常用Fimo扫描基因组序列得到motif对应的序列位置,进而进行下一步的分析。说明文档可参...[作者空间]
已有的工具如circos, 只能绘制弯的染色体,又如R包chromoMap,IdeoViz,karyploteR,...[作者空间]
为了帮助无信息学背景、信息学初入门者,甚至比较熟练的学者简化相关分析流程,我们开发了一款微生物基因组学和比较基因组...[作者空间]