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    群体遗传学

    • MatrixEQTL-----eQTL分析
      0
      2024-02-29
    • MatrixEQTL-----eQTL分析好久没有发简书了,去学习新技术新知识去了,实在是没有时间!!现在有点时间,记录分享一下新知识~这段时间也是被这个e...[作者空间]

    • 2016《Cell Research》全基因组重测序研究狗的驯化
      0
      2023-04-14
    • 2016《Cell Research》全基因组重测序研究狗的驯化动物经过了漫长的驯化和文明交流过程,它们的样子跟其祖先相比,发生了太多的变化,早已无从分辨。然而,我们依然可以从它...[作者空间]

    • 2023《Science》 葡萄的双重起源
      0
      2023-03-22
    • 2023《Science》 葡萄的双重起源Science 发表了题为“Dual domestications and origin of traits in...[作者空间]

    • Matrix eQTL分析
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      2022-03-13
    • Matrix eQTL分析目前针对QTL分析有很多软件,比如Plink、 Merlin、R/qtl、FastMap等等,今天给大家分享一下如...[作者空间]

    • 每周文献 2022-01-05
      0
      2022-01-05
    • 每周文献 2022-01-05大家好,本周给大家分享的是2021年12月份发表在Current biology上与中国家马体型相关主效基因突变的...[作者空间]

    • 群体进化选择消除分析
      0
      2021-12-29
    • 群体进化选择消除分析要做选择性消除分析,首先就要把如下的理论记住熟记于心。 中性进化假说: 分子水平上,生物的演化或物种的进化并不是自...[作者空间]

    • 基因流分析——Treemix
      0
      2021-11-27
    • 基因流分析——Treemix基本概念: 基因流(也称基因迁移) 是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质,从而改变群体“基因库”的...[作者空间]

    • fastsimcoal2 推断群体演化历史案例
      0
      2021-11-24
    • fastsimcoal2 推断群体演化历史案例案例一 IM20Mb.tpl IM20Mb.est run line .tpl中字母代表的是要估计的参数,有些给定...[作者空间]

    • 全基因组重测序流程【超细致!!】
      0
      2021-12-18
    • 全基因组重测序流程【超细致!!】自己在研究生的第一个项目就是处理重测序数据,在做的过程中参考了很多资料,现在把整个重测序的上游分析流程分享给大家,...[作者空间]

    • 全转录组关联分析TWAS的原理与方法
      0
      2021-07-10
    • 全转录组关联分析TWAS的原理与方法作者:Resther审稿:童蒙编辑:angelica 什么是TWAS 对GWAS(genome-wide asso...[作者空间]

    • ROH、近交系数、亲缘系数、IBD、IBS
      0
      2021-05-12
    • ROH、近交系数、亲缘系数、IBD、IBS连续纯合片段(runs of homozygosity, ROH)是亲代将同源相同的单倍型传递给子代而形成的,基于...[作者空间]

    • fastsimcoal2推断群体演化历史(Demographic
      0
      2021-04-15
    • fastsimcoal2推断群体演化历史(Demographic1. 群体演化历史分析的案例: 群体演化包括有效群体大小(Ne)变化、基因流,迁徙,分化等,会对等位基因频率产生显...[作者空间]

    • 基于Vcf文件进行基因单倍型分析
      0
      2021-04-10
    • 基于Vcf文件进行基因单倍型分析单倍型,是单倍体[https://baike.baidu.com/item/%E5%8D%95%E5%80%8D%...[作者空间]

    • Ubuntu16.04安装最新版R4.0和RStudio Ser
      0
      2021-03-22
    • Ubuntu16.04安装最新版R4.0和RStudio Ser1. 安装R(需要ROOT权限)安装R官方安装说明[https://mirrors.tuna.tsinghua.e...[作者空间]

    • 选择压力分析,从序列下载到结果绘图
      0
      2021-01-29
    • 选择压力分析,从序列下载到结果绘图选择压力及基因在进化过程中所受到的压力,也称自然选择。 在遗传学中, Ka/Ks或者dN/dS表示的是非同义突变频...[作者空间]

    • 2021-01-04根据SNP验证自然选择—XPEHH分析
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      2021-01-04
    • 2021-01-04根据SNP验证自然选择—XPEHH分析转载自https://mp.weixin.qq.com/s/1IM6KSCGIq0cUJhKKXVcIw 背景 选...[作者空间]

    • 用snpEff产出的vcf提取4DTv位点,构建进化树
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      2020-12-04
    • 用snpEff产出的vcf提取4DTv位点,构建进化树用snpeff产出的vcf提取4DTv位点,用于构建进化树 转载自https://blog.csdn.net/u...[作者空间]

    • 基因流分析——D统计
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      2021-05-11
    • 基因流分析——D统计基本概念 基因渗入(introgression): 是在遗传学中,指两个基因库间的基因流动,通常是经过种间杂交产生...[作者空间]

    • 如何确定基因拷贝数
      0
      2020-07-26
    • 如何确定基因拷贝数基因拷贝数概念 基因拷贝数是指某一种基因或某一段特定的DNA序列在单倍体基因组中出现的数目。也可以简单理解为基因组...[作者空间]

    • ANNOVAR | 变异注释【上】
      0
      2020-09-15
    • ANNOVAR | 变异注释【上】一、简介 会得到一系列变异数据,这些变异数据只是告诉我们在基因组的某个位置发生了一段序列的改变,至于这个改变会不会...[作者空间]

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