Orthofinder产生的Orthogroups.GeneCount.tsv不能直接作为CAFE软件的输入文件,...[作者空间]
上一步差异表达分析拿到了表达谱【比如当用药物处理之后,实验组中哪些基因的表达发生了变化】 GO数据库 Gene ...[作者空间]
这几天需要做八十多个种的比较基因组,网上找了半天没有提取intron(内含子区)和intergenic regio...[作者空间]
前面我们简单介绍过ggplot2画KEGG富集柱形图[https://link.zhihu.com/?target...[作者空间]
参考地址[https://www.jianshu.com/p/9d28de3d18e6]Ka/Ks和4DTv用于分...[作者空间]
1、下载GOA文件,下载网址如下:http://current.geneontology.org/annotati...[作者空间]
前面简单介绍过基因矩阵转置文件格式(* .gmt)[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz...[作者空间]
AgriGO是一款进行基因GO注释的在线软件,可快速且方便的对所需基因进行基因注释 直通车,戳这里 简单流程 以甜...[作者空间]
WEGO是华大基因公司的一个在线GO注释的网站,根据网站的介绍:WEGO(网络基因本体注释图)是一个简单但有用的工...[作者空间]
上个教程中已经修改了进化树的分支颜色和标签颜色,接下来进行热图绘制 数据准备 我们可以从help界面查看我们需要输...[作者空间]
简要介绍利用eggNOG进行在线注释GO 其原理将query序列与eggNOG编号的蛋白进行多序列比对,确定保守位...[作者空间]
系统发育推断(phylogenetic inference)的算法五花八门,从最简单的UPGMA法,到邻接法(ne...[作者空间]
导读 要点: !duplicate函数去重做索引 table函数去重统计 order函数进行排序 ggplot g...[作者空间]
很多基因组数据库中只有基因组,CDS和蛋白质序列,而没有基因的序列,这就需要我们自己去提取 1. 输入文件 首先我...[作者空间]
NCBI(National Center for Biotechnology Information)https:...[作者空间]
导读 从网上收集的一些数据库信息,方便学习查看: VFDB PHI TCDB Swiss Prot Pfam GO...[作者空间]
写在前面 对于没有做过共线性分析的小伙伴,可以通过以下几段内容,了解一下,我为什么要费劲巴拉画出这样一张图。 除了...[作者空间]
Batch SMART 是 TBtools 的 插件一号。发布之后,感兴趣的人确实很多。说实话,不需要去看邮箱里增...[作者空间]
https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg2MDA2MDQzMQ==&mid=224...[作者空间]
分析内容如下图所示: 具体分析步骤如下: 数据质控,使用 kneaddata 软件, 该软件先调用 Trimmom...[作者空间]