单细胞数据爆发，现在细胞数据随便就是万和百万级别，除了有许多专门开发出来快速处理百万级的工具包（例如Cumulus...[作者空间]
bug千千万，改完又忘，忘了又出…… 记录在Seurat分析中各种各样的花式bug们 1. FindVariabl...[作者空间]
二代、三代测序被广泛应用，组学数据爆发，经常会遇到需要可视化比对效果的情况，常用的可是化工具就是IGV, samt...[作者空间]
pyscenic在通过loom文件读入单细胞数据运行，最后会生成所有的文件，包括最后一步AUCell的结果，但是实...[作者空间]
一、pyscenic的结果不可重复 最近在运行pyscenic的结果的时候发现了两次相同参数相同数据的结果存在不一...[作者空间]
1.背景 单细胞数据分析在进行完细胞自聚类或者细胞类型注释后，一般需要对查到的差异基因可视化，用来显示基因和细胞群...[作者空间]
热图（Heatmap）作为展示基因表达模式最直观的工具。它经常用在分子生物学文章里（尤其是microarray, ...[作者空间]
无论是单细胞、空间组还是ATAC的数据，有时由于下游分析的需求或可视化的需求，同时由于python的运算速度的优势...[作者空间]
在使用Seurat时，经常需要对不同分类的样本在同一画布上进行可视化，可以非常方便地通过其DimPlot()函数的...[作者空间]
关键词 FindTransferAnchors函数 TransferData函数 细胞类型注释 映射数据集/Tra...[作者空间]
这是一般的聚类图 突出显示每个簇的分布展示[作者空间]
实现基于t-SNE坐标，然后用某item的值来体现在颜色上，同时显示基于item值过滤后的密度图 数据集如下： 现...[作者空间]
