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    生信专题

    • 「基因组」评估目录
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      2024-01-05
    • 「基因组」评估目录「基因组」compleasm评估基因组busco[https://www.jianshu.com/p/8178b1...[作者空间]

    • Singularity 容器
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      2023-11-07
    • Singularity 容器Singularity 是一种流行的容器技术,专为高性能计算(HPC)和科学计算应用设计。与 Docker 等其他...[作者空间]

    • 基因功能注释
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      2023-07-18
    • 基因功能注释基因功能注释,简单来说,即是根据已有的蛋白库,对从基因组上提取到的蛋白序列进行比对,从而获得相应的信息。 这里整理...[作者空间]

    • 物种分歧时间的估计以及基因家族的收缩与扩张
      0
      2023-06-06
    • 物种分歧时间的估计以及基因家族的收缩与扩张0.软件的安装略1.物种树的构建参见 https://www.jianshu.com/p/336b65ca1b67...[作者空间]

    • 「基因组」着丝粒和端粒鉴定软件
      0
      2023-04-16
    • 「基因组」着丝粒和端粒鉴定软件最近状态不佳,连续两件事情做的时候只想到了一半,做了又等于没做,都成了自己预想的最差的结果,要想做到最佳,只有重做...[作者空间]

    • 群体遗传|根据SNP验证自然选择
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      2023-03-05
    • 群体遗传|根据SNP验证自然选择XPEHH参见: https://mp.weixin.qq.com/s/1IM6KSCGIq0cUJhKKXVcI...[作者空间]

    • 皮尔森(逊)相关系数(Pearson Correlation C
      0
      2023-02-15
    • 皮尔森(逊)相关系数(Pearson Correlation C介绍 皮尔森相关系数 皮尔森相关系数也称皮尔森积矩相关系数(Pearson product-moment corr...[作者空间]

    • 泛基因组分析流程psvcp:试着运行流程中提供的示例数据
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      2023-02-06
    • 泛基因组分析流程psvcp:试着运行流程中提供的示例数据流程github 主页 https://github.com/wjian8/psvcp_v1.01[https:/...[作者空间]

    • R语言绘制环状热图实操1
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      2022-11-22
    • R语言绘制环状热图实操1# rm(list=ls())#clear Global Environment# setwd('F:\\RStu...[作者空间]

    • 生信步骤|MAFFT结合HMMER进行多序列比对和基于隐马模型的
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      2022-11-19
    • 生信步骤|MAFFT结合HMMER进行多序列比对和基于隐马模型的蛋白质都是由相似的小型结构域组成的。如果我们有若干个已知的蛋白序列,那我们就可以根据这些蛋白序列比较其含有的保守域...[作者空间]

    • 【块】生信上游-5 StringTie
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      2022-10-25
    • 【块】生信上游-5 StringTiehighly efficient assembler of RNA-Seq alignments into pot...[作者空间]

    • 更新go和kegg注释
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      2022-09-14
    • 更新go和kegg注释非模式物种 step1:注释把本物种的蛋白序列用diamond到eggnog数据库比对 拿到eggnog的注释结果...[作者空间]

    • 生信步骤|kmc+genomescope进行基因组调查
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      2022-09-14
    • 生信步骤|kmc+genomescope进行基因组调查在组装未知基因组时,往往需要利用重测序数据提前进行基因组调查,以获取其基因组规模,杂合率,重复序列比例,GC含量等...[作者空间]

    • 利用蓝目菊和蝶豆花基因共转获得紫色-紫罗兰色菊花
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      2022-09-13
    • 利用蓝目菊和蝶豆花基因共转获得紫色-紫罗兰色菊花图2 OhF3'5'H和CtA3'5'GT对菊花花色苷合成代谢产物的修饰[作者空间]

    • SPAdes使用方法(基因组拼接)
      0
      2022-09-06
    • SPAdes使用方法(基因组拼接)第一步安装软件 第二步转到工作目录 第三步,拼装序列 第四步,导出输出文件[作者空间]

    • ML树软件iqtree2的安装与使用
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      2022-08-27
    • ML树软件iqtree2的安装与使用1.安装 2.运行[作者空间]

    • 基因组拼装软件getorganelle
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      2022-08-27
    • 基因组拼装软件getorganelle1.安装getorganelle 2.安装blast(需依靠其下载各种数据库)先将blast的压缩包下载到Wind...[作者空间]

    • 易基因:植物宏病毒组研究:植物病毒的进化与生态 | 顶刊综述
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      2022-08-01
    • 易基因:植物宏病毒组研究:植物病毒的进化与生态 | 顶刊综述美国亚利桑那州立大学生命科学学院Pierre Lefeuvre等人以“Evolution and ecology ...[作者空间]

    • 单细胞转录组流程一:安装运行cellranger及结果解读
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    • 单细胞转录组流程一:安装运行cellranger及结果解读单细胞分析流程之Cell Ranger 相信做单细胞的小伙伴对Cell Ranger这个软件都不陌生,我们今天就来...[作者空间]

    • Multi-omics Hammer软件之fasta格式整理和保
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      2022-08-01
    • Multi-omics Hammer软件之fasta格式整理和保上一篇推文主要介绍了一下Multi-omics Hammer软件的Aligment功能,本篇就接着上一篇推文继续介...[作者空间]

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