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    生物信息分析

    • 报错:Error: ncbi::objects::CSeq_id
      0
      2023-12-05
    • 报错:Error: ncbi::objects::CSeq_id遇到一个报错,困扰了很久,报错信息如下: 重点还是: Error: ncbi::objects::CSeq_id:...[作者空间]

    • 「干活」基因组组装 学习笔记 - 入门知识点和Genome Su
      0
      2022-10-13
    • 「干活」基因组组装 学习笔记 - 入门知识点和Genome Su基因组组装学习笔记(一) 基因组组装的前期工作:需要掌握什么知识点? 1)基因组大小 / genome size:...[作者空间]

    • busco软件使用详解
      0
      2022-12-12
    • busco软件使用详解BUSCO[https://busco.ezlab.org] - 组装质量评估软件 BUSCO - Benchma...[作者空间]

    • bedtools coverage 和 samtools bed
      0
      2022-03-30
    • bedtools coverage 和 samtools bed最近需要将bam文件映射到bed上并统计,一番尝试操作之后发现:貌似samtools bedcov 和 bedto...[作者空间]

    • bam文件画插入片段长度分布图
      0
      2022-03-30
    • bam文件画插入片段长度分布图对于ATAC文库而言,其插入片段的长度分布有着非常典型的规律,示意如下 每200bp会存在一个峰,这个周期性波动反...[作者空间]

    • UCSC Genome Browser repeats-Repe
      0
      2022-03-29
    • UCSC Genome Browser repeats-RepeRepeatMasker(http://www.repeatmasker.org/[http://www.repe...[作者空间]

    • 获取Unique reads
      0
      2022-03-28
    • 获取Unique reads在NGS数据中,Unique reads指的是只能map到一个位置的reads。要判断一条read是否unique...[作者空间]

    • Flag值转换对应关系
      0
      2022-03-28
    • Flag值转换对应关系---------------------------------------------------------...[作者空间]

    • 通过bam文件提取mapped read或unmapped re
      0
      2022-03-24
    • 通过bam文件提取mapped read或unmapped re通过比对软件,我们会得到比对率,但也有一些没有比对成功的read,如果想单独拎出来那些没有比对成功的read,需要...[作者空间]

    • 一文读懂:基因的功能富集分析
      0
      2022-03-23
    • 一文读懂:基因的功能富集分析富集分析 基因富集分析(gene set enrichment analysis)是在一组基因或蛋白中找到一类过表...[作者空间]

    • 认识MAPQ(Mapping Qualities)
      0
      2022-03-22
    • 认识MAPQ(Mapping Qualities)MAPQ(Mapping Qualities) 用来表示每条read的比对情况,MAPQ越高,表示比对质量越好,后...[作者空间]

    • 奇奇怪怪的gene symbol
      0
      2022-03-15
    • 奇奇怪怪的gene symbol有一些基因的symbol很奇怪,真百思--不得姐呀!比如: 纯字母开头 C orf 系列基因,HS.系列基因,KR...[作者空间]

    • Error in get(name, envir = asNam
      0
      2022-03-14
    • Error in get(name, envir = asNam问题来源 今天安装clusterProfiler包的时候出现这样的报错 解决思路 把错误关键词get_fun_fr...[作者空间]

    • R画图数据对不上?---- 可能是数据空值读取有问题,解决办法来
      0
      2022-03-13
    • R画图数据对不上?---- 可能是数据空值读取有问题,解决办法来最近用一组数据画图,发现数据老对不上,哭唧唧。。。。擦干眼泪还得继续不是,手动微笑(* ̄︶ ̄)最后发现是空值的问题...[作者空间]

    • 用VennDiagram画Venn图
      0
      2022-03-13
    • 用VennDiagram画Venn图两图 三图 四图 五图 画PDF格式 导出Venn图的list TEST_venn_inter.txt: ----...[作者空间]

    • R中文件合并怎么做?
      0
      2022-03-11
    • R中文件合并怎么做?merge 通过一个或者多个变量进行连接 cbind 横向合并,不需要指定索引,必须拥有相同的行数 用R做文件合并...[作者空间]

    • Evenn:在线venn图绘制网站
      0
      2022-03-11
    • Evenn:在线venn图绘制网站2021年8月2日,JGG在线发表了题为“EVenn: Easy to create repeatable and...[作者空间]

    • 常用的DNA、RNA比对软件总结
      0
      2022-03-08
    • 常用的DNA、RNA比对软件总结DNA-seq(maybe不需要拆分比对):bowtie;bowtie2;BWARNA-seq(maybe需要拆分...[作者空间]

    • 报错:EOF within quoted string
      0
      2022-03-07
    • 报错:EOF within quoted string今天突然出现了这样一个报错: 输入的命令是: 根据提示,说明函数的输入有问题,所以: 修正后的代码: 在读取命令中...[作者空间]

    • ENCODE-Blacklist:基因组也有“黑名单”了
      0
      2022-02-15
    • ENCODE-Blacklist:基因组也有“黑名单”了黑名单:顾名思义,就是有问题的区域!具体怎么定义,包含哪些信息呢?咱来详细唠一唠: 在The ENCODE Bla...[作者空间]

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