8月1日邵峰院士出席青年科学家论坛做了“细胞焦亡主力癌症免疫治疗”的演讲。引起大家对细胞焦亡的广泛关注。 当然这不...[作者空间]
转录组分析是生信分析的一个基础和常见的分析流程,一般从下机数据开始,经过一系列的质控,基因组比对,差异分析等过程得...[作者空间]
生信星球学习小组第92期 本期的主题是测序知识 怎么区分一二三代测序&二代测序大体流程↓ 公司是怎样测序的↓ 文章...[作者空间]
Conda Conda是什么 Conda 是一个开源的软件包管理系统和环境管理系统,用于安装多个版本的软件包及其依...[作者空间]
前言 最近有幸加入生信技能树的单细胞数据挖掘尝鲜群[https://mp.weixin.qq.com/s/3XyA...[作者空间]
原创来自https://mp.weixin.qq.com/s/xw-x_r9yq6Iiw-4LwyKvWw,本人稍...[作者空间]
作者:jzhang Update:2020-07-12 Emali:jzhang910@qq.com 前言:我们都...[作者空间]
经典赏析 NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、C...[作者空间]
一般做完差异基因,或者使用其他方法找到想要的biomarker时,想要知道这些基因的调控网络,或者哪些基因在调控网...[作者空间]
如前所说,过表达富集分析有不少缺点。因此以GSEA为代表的FCS方法也是人们所倾向的选择。接下来将简单了解下方法原...[作者空间]
NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-...[作者空间]
第一部分,学习甲基化的基础知识,参考资料:甲基化的基础知识 第二部分,甲基化芯片分析的一般流程,包括了甲基化信号值...[作者空间]
关于概念问题,很重要 第1篇:ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同https://mp.weix...[作者空间]
一般我们做GSEA都是先进行差异基因分析,然后取差异倍数排序结果进行GSEA。但如果你没有条件进行差异基因分析也可...[作者空间]
一 . 从GEO数据库中下载表达矩阵文件 GSE112996_merged_fpkm_table.txtGSE11...[作者空间]
一个基因在不同的数据库有不同的名字:1.Entrez gene ID:我们一般说的Gnen ID即Entrez g...[作者空间]
读取文件 对原ID进行分割 把分割好的list文件转换为matrix 取其中的第一列,得到ensemble_id ...[作者空间]
本文教程链接主要来源于百度经验上的一位化学博士。 这款软件比较适合写论文时管理文献,插入文献格式找endnote就...[作者空间]
刘小泽写于18.12.11这次是应花花的邀请,学习下基因芯片的相关知识,我们现在了解NGS比较多,但是在它之前,芯...[作者空间]