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    • 生信log21|基因组成圈了吗?-拼接路径可视化软件Bandag
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      2021-12-06
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      2021-09-14
    • 生信log18|一个上传基因组到NCBI的图文详细教程开篇废话一下:> 这篇日志分享的实际上是我总结了NCBI基因组上传流程并分享给组内同学参考的PPT教程,当然我们P...[作者空间]

    • 生信log19|原核基因组分析part2-本地个性化分析(序列建
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      2021-10-15
    • 生信log19|原核基因组分析part2-本地个性化分析(序列建?这篇写得太久了,还有很多不满意的地方,决定先放出来再慢慢完善。刚来实验室的那会儿,经常听到实验室的师兄说建库,p...[作者空间]

    • 生信log12|"Dataset"-NCBI批量下载基因组数据新
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      2021-08-08
    • 生信log12|"Dataset"-NCBI批量下载基因组数据新写在前言,虽然笔主真的很喜欢几行命令行就能解决很多重复劳动,但本人还是被傻瓜式软件吃得死死的,哎真香。在此介绍一下...[作者空间]

    • 生信log10|网页版|RobeTTaFold-蛋白质预测尝鲜记
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      2021-07-19
    • 生信log10|网页版|RobeTTaFold-蛋白质预测尝鲜记最近AlphaFold2开源了,然后另一个灵感来自AlphaFold的RobeTTaFold[https://ro...[作者空间]

    • markdown语法|emoji用代码敲表情包
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      2021-07-12
    • markdown语法|emoji用代码敲表情包感觉啥都能用代码敲就很棒啊,期待明年此时在文本上面的编辑已经完全脱离鼠标,此篇记录一下代码编辑笔记的日常 语法规则...[作者空间]

    • 生信log9|(MacOS)记core-pan泛基因计算工具Ro
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      2021-07-09
    • 生信log9|(MacOS)记core-pan泛基因计算工具Ro前言背景前段时间重装系统Anaconda全没了,重装了之后就没咋管过,直到最近要用到Roary,conda con...[作者空间]

    • 生信log8|Biostar踩坑(MacOS)|sra-tool
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      2021-05-22
    • 生信log8|Biostar踩坑(MacOS)|sra-tool前言 兴高采烈地照着书本打算稳扎稳打过一遍zika RNA-seq这一篇分析,结果一上来就频频报错。 平台: Ma...[作者空间]

    • 生信log7|用barrnap在细菌全基因组中抽取16sr RN
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      2021-05-19
    • 生信log7|用barrnap在细菌全基因组中抽取16sr RN使用软件:barrnap(需要在合适的环境中配合运行) barrnap其实 除了自己一个文件以外,还会配合bedt...[作者空间]

    • 生信log6细菌全基因组建树|基于GTDB-KT抽单拷贝蛋白序列
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      2021-05-21
    • 生信log6细菌全基因组建树|基于GTDB-KT抽单拷贝蛋白序列前言 最近在跑一个很大的数据集,大概有3500条以上的基因序列,因为数量太大,跑树有点搞不定,特此来记录一下这个过...[作者空间]

    • 生信log5|Biostar|global/local-alig
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      2020-08-13
    • 生信log5|Biostar|global/local-alig脚本的出错 打开一比对结果发现报错了!说是第四十一行多了个括号 打开看一下41行长什么样子Screenshot 2...[作者空间]

    • 生信log4|Biostar生信学习小记(MacOS平台)|zc
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      2020-05-10
    • 生信log4|Biostar生信学习小记(MacOS平台)|zc所以理论跟实践又是另外一回事了!!!! MacOS 上运行zcat结果出现了zcat: can't stat: p...[作者空间]

    • 生信log3|Biostar生信学习小记|Taxonkit踩坑记
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      2020-05-03
    • 生信log3|Biostar生信学习小记|Taxonkit踩坑记平台:MacOS,系统:Catalina 初次使用刚装上开箱后就用 结果出现了上图的报错,查找了官网发现,原来还需...[作者空间]

    • 生信log2|从Genbank(gbk/gbff)文件中提取序列
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