近日，由山东第一医科大学附属省立医院（山东省立医院）“内分泌糖脂代谢与脑老化”教育部重点实验室、复旦大学生命科学学...[作者空间]
现有的多模态数据模型通常在功能或可扩展性方面受到限制，使得数据集成和下游分析变得繁琐。2024年11月，《Natu...[作者空间]
2024年7月《Briefings in Functional Genomics》发表综述文章，概述了人类基因组学研究中使用率较高的50多种在线资源。 精选在线数据库 精选在...[作者空间]
定义组织中不同细胞类型的数量和丰度对于理解疾病机制以及诊断和预后目的非常重要。一般通过免疫组织学分析、细胞分选或单...[作者空间]
目前如何将特定的 "表观标记 "与细胞和生物过程特定背景下的基因表达联系起来仍是一个重大挑战。2024年1月，《Briefings in Bioinformatics》发表了...[作者空间]
新抗原来源于肿瘤中的体细胞突变，在正常组织中不存在。新出现的证据表明，新抗原可以刺激肿瘤特异性T细胞介导的抗肿瘤免疫反应，因此是潜在的免疫治疗靶点。2024年2月，《Brie...[作者空间]
去卷积是根据各种组学数据估计细胞类型丰度的有效方法。尽管近年来去卷积分析方法取得了重大进展，但挑战仍然突出。2024年2月，《Nature Methods》发表Perspec...[作者空间]
作物基因组学在过去十年中发展迅速，从多组学研究中产生了大量的组学数据。如何利用积累的数据成为作物科学的一个关键而迫切的需求。 生菜（Lactuca sativa L.）属菊科...[作者空间]
错配修复缺陷（dMMR）/微卫星不稳定性（MSI）是结直肠癌（CRC）的关键生物标志物。目前建议对CRC患者进行MSI状态的普遍筛查，但这增加了病理学家的工作量，延误了治疗决...[作者空间]
宏基因组学是理解生物体相互作用的强大工具；然而，在菌株水平上对相互作用进行分类、分析和检测仍然是一项挑战。2023年10月，《Briefings in Bioinformat...[作者空间]
微生物群落通过代谢物串扰维持其生态动态。因此，了解代谢组及其种群将有助于了解群落的功能，并预测它在非典型条件下的变化。2023年9月，《Briefings in Bioinf...[作者空间]
基因组表现出具有片段拷贝数变异的大区域，其中许多包括整个基因并且是多等位基因。2023年10月，《Scientific Reports》发表了一种新的alignment-fr...[作者空间]
长读长测序技术有利于基因组组装，但其序列错误率较高。虽然已开发了具有不同视角的各种组装程序，但尚未对具有不同杂合性的二倍体基因组的长读长组装程序进行系统评估。2023年10月...[作者空间]
缺乏带有内置基准数据集的情况下，比较现有长读长异构体检测和差异表达分析工作流程的性能具有挑战性。2023年10月，《Nature Methods》发表了一项成果，研究团队设计...[作者空间]
2023年10月23日，国家基因库生命大数据平台支撑科研成果在《Nucleic Acids Research》发表。该研究题为“A high-resolution haplo...[作者空间]
流式细胞术 (FCM) 可以在短时间内以合理的成本研究来自数百万个细胞和数百个样本的数十个参数，其生成的数据量相当可观。计算方法可用于识别新的亚群和分子生物标志物，但通常需要...[作者空间]
多组学数据集的综合分析已被证明在癌症研究和精准医学中是非常有价值的。然而，整合不同组学的多个数据集仍然是一个挑战。近日，《Nucleic Acids Research》发表了...[作者空间]
Hi-C技术对高阶染色质结构进行全基因组研究正在成为理解基因调控机制的重要组成部分。可视化多组学数据并使用交互式浏览器进行直观分析成为一种强大且流行的方式。近日，《Brief...[作者空间]
宏基因组组装的目的是从宏基因组测序数据中重建微生物基因组。这种方法从根本上推进了对宿主相关微生物群落和自由生活微生物的研究。2023年3月，《Briefings in Bio...[作者空间]
在药物发现的流程中，一个关键的限制步骤是对感兴趣的蛋白靶标进行潜在药物分子的实验筛选。快速准确地进行药物-靶标相互作用（DTI）的计算预测可以加速药物发现过程。近日，《Pro...[作者空间]
