https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s1...[作者空间]
前言:这是一篇可以归纳与纯生信的文章,做转录组数据分析都适用学习,基础型文章。这篇文章发表期刊:MBC Genom...[作者空间]
一.流程介绍 后续会开发lncRNA、smallRNA、circRNA流程首先是lncRNA流程,主要分析模块为:...[作者空间]
参考资料 Plant Long Non-Coding RNAs 第十三章An Easy-to-Follow Pip...[作者空间]
之前写过一个从sRNA-seq数据中查找miRNA表达量的脚本,但是很傻,每换一个物种,需要守在电脑旁,输入下一个...[作者空间]
上次讲到sRNA数据如何去接头,那么接下来的常规操作是什么? 一、去冗余(collapse)--- 用于比对的数据...[作者空间]
摘要 测了拟南芥整个生长阶段的来自27个不同组织或器官的小RNA。对测序数据进行分析之后发现大多数的miRNA...[作者空间]
参考0参考1miRNA预测工具miRDeep-P2简明教程植物miRNA靶基因预测下机数据整理汇总find -na...[作者空间]
文献信息 标题:Global identification of Arabidopsis lncRNAs reve...[作者空间]
什么是lncRNA lncRNA 的全称是long noncoding RNA。即又长又表达且还不能编码翻译成蛋白...[作者空间]
[1]Szabo L, Salzman J. Detecting circular RNAs: bioinform...[作者空间]
这篇文章用公共数据发表到了 scientific report,影响因子为4.29。 0. 文章idea来源 近年...[作者空间]
这个时候已经不是表达矩阵的事情了,要从新从fastq测序数据开始。对测序后的fastq数据进行转录本的组装。基于组...[作者空间]