1. Hisat2-featureCounts流程 1.1 shell-script001
摘录:生信技能树论坛 Kai statquest 要求:实现这个功能的软件也很多,还是烦请大家先自己搜索几个教程,...[作者空间]
写在前面的废话 最近在处理一批RNA-seq的数据,里面混入了spike-in。利用spike-in矫正之后,样本...[作者空间]
前言——主要内容 这篇笔记是StatQuest系列笔记的第63节,这篇笔记跳过59节,60节,61节主要是因为第6...[作者空间]
Every cell is unique—it occupies an exclusive position in...[作者空间]
@我的博客:有味 导读 目前用于代谢组学数据的液相色谱和质谱分析的工具只涵盖有限的处理步骤,而在线工具很难以可编程...[作者空间]
原文链接:hisat2:比对基因组工具简介_生信修炼手册_传送门 由于测序仪机器读长的限制,在构建文库的过程中首先...[作者空间]
背景介绍 随着癌症基因组学的进步,突变注释格式(MAF)被广泛接受并用于存储检测到的体细胞变体。 癌症基因组图谱项...[作者空间]
无生物学重复RNA-seq分析 CORNAS: coverage-dependent RNA-Seq analys...[作者空间]
变异检测算法的核心就是从尽可能找到真实的变异,降低假阳性。尽管目前测序仪器的准确性可以达到99.999%,似乎很高...[作者空间]
转录组学习一(软件安装) 转录组学习二(数据下载) 转录组学习三(数据质控) 转录组学习四(参考基因组及gt...[作者空间]
Introduction to Bioconductor for Sequence Data 在院士组轮转的时候,...[作者空间]
callpeak用法 这是MACS2的主要功能,因为MACS2的目的就是找peak,其他功能都是可有可无,唯独ca...[作者空间]
高通量短读比对工具 在过去的十几年里,随着高通量测序(HTS)成本降低,出现了各种测序概念, DNA-Seq, C...[作者空间]
网络爬虫(web crawler),也叫网络蜘蛛(spider),是一种用来自动浏览万维网的网络机器人。其目的一般...[作者空间]
生信技能树的转录组学习开班了, 第一个任务是安装软件, 于是我花了一个下午时间和Linux斗智斗勇。 系统准备 w...[作者空间]