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    • SRA数据几种常用的下载方法
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      2022-02-08
    • SRA数据几种常用的下载方法依据大家上传数据的习惯,绝大多数生物信息学数据都是可以从NCBI上下载到,当然也可以通过DDBJ,EBI去下载。另...[作者空间]

    • snakemake常见功能记录
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      2021-08-29
    • snakemake常见功能记录通配符的使用 进阶操作 Expend(自定义数组) 进阶操作 Threads与Resources Messages...[作者空间]

    • 下载微生物16S rDNA序列并用MEGA-X构建进化树
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      2021-06-22
    • 下载微生物16S rDNA序列并用MEGA-X构建进化树整理:王采荷 一、下载同一种属不同species下的微生物16S rDNA 使用NCBI网站:https://ww...[作者空间]

    • 超级爽!~精细比较近源物种 / 单倍型 / 基因组的神器!
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      2021-05-18
    • 超级爽!~精细比较近源物种 / 单倍型 / 基因组的神器!写在前面 三年前,那时往“全国植物基因组会议”投个了摘要,也准备了下墙报,有点期待能得到点认可。当然和以前一样,优...[作者空间]

    • MACS2软件call m6A甲基化peaks
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      2021-05-16
    • MACS2软件call m6A甲基化peaks前面给大家介绍了☛m6A甲基化数据分析流程[https://link.zhihu.com/?target=http...[作者空间]

    • 基因家族分析(3) ggplot2绘制基因结构图
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      2021-05-13
    • 基因家族分析(3) ggplot2绘制基因结构图本节我们继续来进行基因家族数据可视化的第3节教程,通过ggplot2绘制一个富有美感的基因结构图&蛋白保守结构域图...[作者空间]

    • 复现1:AD的GWAS位点关联基因挖掘
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      2021-05-10
    • 复现1:AD的GWAS位点关联基因挖掘Title:Mapping Alzheimer's Disease Variants to Their Targe...[作者空间]

    • 跟着Nature Genetics 学画图:R语言ggplot2
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      2021-05-06
    • 跟着Nature Genetics 学画图:R语言ggplot2今天推文重复的图来自于 论文Whole-genome resequencing of 445 Lactuca ac...[作者空间]

    • snpEff注释变异位点信息
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      2021-04-20
    • snpEff注释变异位点信息SnpEff是一种变体注释和效果预测工具,它注释和预测遗传变异的影响(例如氨基酸变化)。 1. 软件安装 2. 运...[作者空间]

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      2021-04-13
    • 基于vcf文件进行Admixture群体结构分析ADMIXTURE 是常用的群体遗传学分析工具,可以估计个体的祖先成分。与 STRUCTURE 相比,它的速度更快...[作者空间]

    • gatk4 gatk VariantFiltration 报错
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      2021-04-12
    • gatk4 gatk VariantFiltration 报错我分染色体执行GATK硬过滤的时候出现发现输出文件显著小于原文件,报错内容如下 java.lang.NumberF...[作者空间]

    • 基于Vcf文件进行基因单倍型分析
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      2021-04-10
    • 基于Vcf文件进行基因单倍型分析单倍型,是单倍体[https://baike.baidu.com/item/%E5%8D%95%E5%80%8D%...[作者空间]

    • GATK 4.1.7.0 call SNP
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      2021-03-31
    • GATK4.0之后和之前的版本存在较大差异,因此需要使用特定版本来call变异时需要有较大的改动,call变异的过...[作者空间]

    • 测序数据简单分析流程
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    • 测序数据简单分析流程2021/03/25 一、测序数据下载 NCBI SRA 数据库 【使用说明[https://trace.ncbi...[作者空间]

    • TCGA 拷贝数变异(CNV)–使用maftools读取和汇总g
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    • TCGA 拷贝数变异(CNV)–使用maftools读取和汇总g读取和汇总gistic输出文件 maftools : Summarize, Analyze and Visuali...[作者空间]

    • 癌症相关基因组学大数据库
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      2021-03-15
    • 癌症相关基因组学大数据库2021/03/15这里有一些数据库的介绍,极其简单一、High-throughput sequencing da...[作者空间]

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    • 《计算分子进化》练习题探讨-第1章最近在学习杨子恒老师的《计算分子进化》,对于每一章后面的练习题,网上也未必找得到答案,故将自己的计算放到这里,如有...[作者空间]

    • 受选择基因筛选及富集之上卷
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    • 受选择基因筛选及富集之上卷书归正题,我们这次一起来学习一下受选择基因的筛选和富集。做这一方面有很多方法,比如结合Fst,pi,tajimaD...[作者空间]

    • 群体结构分析Admixture 使用遇到报错及解决
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    • InterVar
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    • 2021/03/04  InterVar是用于临床意义变异解释的python脚本,是一种生物信息学软件工具,可根据...[作者空间]

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