CibersortX网站是常用的工具,但是是网页上传数据,现在网页503打不开,而BayesPrism在PMID:...[作者空间]
0.背景知识 TIDE评分越高越容易发生免疫逃逸,免疫治疗获益的可能性就越低,评分>0视为无响应,<0视为有反应。...[作者空间]
作者,Evil Genius 前面介绍了我们机体的免疫系统,但是还是无法阻挡肿瘤发生的命运,而免疫逃逸的问题,无论...[作者空间]
引言 在生物信息学分析中,相信目前估计样本免疫细胞浸润是必不可少的。目前,在R中有多种方法可以实现上述目的,例如E...[作者空间]
官方网站:BayesPrism Gateway[https://www.bayesprism.org/pages/...[作者空间]
影响因子:11.622 细胞衰老(CS)是一种永久生长停滞的状态,与肿瘤的发生密切相关。由于缺乏特定的标记物,研究...[作者空间]
在刷Researcher时看到一篇挺有意思的文章,拿来借鉴学习下。 这是神刊Frontiers in Immuno...[作者空间]
前言 近年来,随着免疫检查点抑制剂的兴起,大大改变了传统的肿瘤治疗策略,尽管 PD-L1 和 dMMR 的检测都获...[作者空间]
2018年的Nature 上公开了一份尿路上皮癌(BLCA)的免疫治疗队列数据,而这份数据就储存在IMvigor2...[作者空间]
1.背景知识 这是一篇2018年的22分文章,《The Immune Landscape of Cancer》将肿...[作者空间]
读CIBERSORT免疫浸润的代码实现[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU4...[作者空间]
最近检查自己的谷歌Gmail邮箱,发现它推送了我感兴趣的一个教授的文章《A Spontaneous Aggress...[作者空间]
目前主流的免疫浸润计算方法是CIBERSORT和ssgsea,今天介绍CIBERSORT。 1.输入数据要什么 下...[作者空间]
肿瘤新生抗原预测的软件有很多,今天测试了一下NeoPredPipe。其预测流程如下图,从VCF文件开始,需要自己提...[作者空间]
前言 一不小心2020年又过完了,回望这一年的收获,算了,还是不回望了。作为2020年的最后一贴,今天来跟大家...[作者空间]
ImmuneCellAI数据库 --RNA-Seq或者芯片数据估计免疫细胞浸润丰度的工具--网址(http://b...[作者空间]
大家好,今天给大家分享一篇有点不一样的肿瘤浸润文章,有3个值得学习的地方:1、不再以基因而是直接根据免疫浸润细胞构...[作者空间]
肿瘤抗原 癌细胞突变生成新的被免疫系统识别成非自身部分的肽链[1]。通常源于单核苷酸突变,极少部分源自多个基因变异...[作者空间]
最近听说定量免疫浸润很火,于是我也报名参加了果子老师的课程,跑了几个R包,你比如说xCell啊,GSVA啊,MCP...[作者空间]
今天给大家分享2020年2月J. Cell. Biochem.(IF=3.448)杂志上的的文章“Identifi...[作者空间]