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    生信下游分析

    • motif 分析
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      2020-07-25
    • motif 分析The MEME Suite http://meme-suite.org/index.htmlJASPAR - a...[作者空间]

    • 一文读懂进化树(图文详解)
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      2020-05-18
    • 一文读懂进化树(图文详解)一、什么是进化树 系统发育进化树 (Phylogenetic tree):** 一般也叫系统进化树,进化树。它可以...[作者空间]

    • 使用ChIPseeker进行peak注释
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      2019-07-18
    • 使用ChIPseeker进行peak注释欢迎关注”生信修炼手册”! ChIPseeker是使用的最广泛的peak注释软件之一,提供了以下多种功能 peak...[作者空间]

    • 使用ChIPpeakAnno进行peak注释
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      2019-07-18
    • 使用ChIPpeakAnno进行peak注释欢迎关注”生信修炼手册”! ChIPpeakAnno是一个bioconductor上的R包,针对peak call...[作者空间]

    • annoPeakR:一个peak注释的在线工具
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      2019-07-18
    • annoPeakR:一个peak注释的在线工具欢迎关注”生信修炼手册”! annoPeakR是一个peak注释工具,基于R语言中的shiny包开发出的web应用...[作者空间]

    • 100篇泛癌研究文献解读之突变全景图
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      2019-05-09
    • 100篇泛癌研究文献解读之突变全景图为了分析不同类型、组织起源肿瘤的共性、差异以及新课题。TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行...[作者空间]

    • GO,KEGG,DO富集分析
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      2019-05-09
    • GO,KEGG,DO富集分析这是我听B站鲮鱼不会飞视频(GO,KEGG,DO富集分析)里的笔记哦~当然有的地方加上的是我自己的理解,如果哪里和...[作者空间]

    • deepTools 使用指南
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      2019-04-24
    • deepTools 使用指南deepTools 是一套基于python开发的工具,适用于有效处理分析高通量测序数据,可用于ChIP-seq, ...[作者空间]

    • DU2:如何准确获取基因的某个保守区域序列
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      2019-04-19
    • DU2:如何准确获取基因的某个保守区域序列需要解决的问题: 准确获取基因X的某个保守区域H的蛋白序列及核酸序列,查看该段序列蛋白层面及核酸层面的变化情况。 ...[作者空间]

    • 系统学习单细胞转录组测序scRNA-Seq(一)
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      2019-03-15
    • 系统学习单细胞转录组测序scRNA-Seq(一)刘小泽写于19.3.15好了,终于可以学新知识了【预计将是一项大工程】,单细胞测序是目前研究的热点,那么我重新回来...[作者空间]

    • TGCA数据的标准化以及差异分析
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      2019-05-05
    • TGCA数据的标准化以及差异分析前面我们从GDC下载了TCGA肿瘤数据库的数据,也能够把GDC下载的多个TCGA文件批量读入R 今天我们讲一下TC...[作者空间]

    • 3D Genome可视化工具
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      2019-01-12
    • 3D Genome可视化工具3D Genome 可视化工具 可视化工具介绍 4D nucleome (http://www.4dnucleom...[作者空间]

    • Mfuzz的使用
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      2019-01-06
    • Mfuzz的使用最近在进行ATAC和RNA-Seq的联合分析,由于处理的材料是时间相关的,所以time-course也是一个可以分...[作者空间]

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    • 非模式物种GO/KEGG富集分析前言:微博参与话题 #给你四年时间你也学不会生信# 先前的富集分析教程[1]主要是以模式物种人为例子,展开的分析,...[作者空间]

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    • 给学徒的ATAC-seq数据实战给学徒的ATAC-seq数据实战 本次给学徒讲解的文章是 :The landscape of accessible...[作者空间]

    • 转录组那些事儿 Part I
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      2018-08-19
    • 转录组那些事儿 Part I刘小泽写于18.8.19之前写过三次关于转录组的实战小文,但是说实话,的确当时还不理解其中的含义,只是想跑个流程,...[作者空间]

    • 第9篇:差异peaks分析——DiffBind
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    • 第8篇:用网页版工具做功能分析和motif分析
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    • 第7篇:用Y叔的ChIPseeker对peaks进行注释和可视化
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    • Week4— chromVAR:预测染色质可及性相关的转录因子
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    • Week4— chromVAR:预测染色质可及性相关的转录因子第四周 2018— 06.11-06.17原文: chromVAR: Inferring transcriptio...[作者空间]

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