还在羡慕海峡那边的朋友下载SRA 快到飞起？还在难过用wget 下载数据经常下载不完整？用了官方的下载工具还是慢的...[作者空间]
欢迎关注"生信修炼手册"！ 对于不同的HLA Allel来说，exon2和exon3 序列的差异性尤为明显，很多的...[作者空间]
刘小泽写于18.8.19之前写过三次关于转录组的实战小文，但是说实话，的确当时还不理解其中的含义，只是想跑个流程，...[作者空间]
原文地址：https://www.jianshu.com/p/1174a53abe7d 作业要求 需要用安装好的s...[作者空间]
前面RNA-seq分析：从软件安装到富集分析部分已经把转录组全部流程走完了一遍，这次利用RNA-seq(2)-2:...[作者空间]
基因表达标准化Normalisation 我们在比较不同样品不同基因的差异表达情况时，期望表达水平分布符合统计方法...[作者空间]
从安装软件到富集分析，完整流程链接整理： RNA-seq(1) :用conda安装RNA-seq所需要的工具 RN...[作者空间]
比对软件很多，首先大家去收集一下，因为我们是带大家入门，请统一用hisat2(官网https://ccb.jhu....[作者空间]
Pysam操作BAM文件 Pysam包是一个处理基因组数据的python模块，它打包了htslib-1.3、sam...[作者空间]
写在前面: 来自生信技能树《生信必修课之软件安装》学会用包管理工具安装软件 查看变量echo $PATH 用户配置...[作者空间]
当进行转录组学数据分析时，会发现有两种数据。一种被称为芯片数据（Microarray data)，另一种是下一代测...[作者空间]
![[转载]RNAseq: TopHat2 + Cufflinks分](https://img.haomeiwen.com/ud/7-0993d41a595d6ab6ef17b19496eb2f21.jpg)
[转载]RNA-seq :TopHat2 + Cufflinks分析流程 测序数据质量控制：fastqc软件 使用...[作者空间]
上周末参加了JIMMY大神的RNA-seq的学习，见到了大神，感觉自己的方法论有个了提升：工具的使用让自己的效率提...[作者空间]
转录组即特定组织或细胞在某一功能状态下所有转录本的总和，包括mRNA和非编码RNA（即Non-coding...[作者空间]
linux基本命令 第六章 Linux文件与目录管理 极客学院服务器 高通量相关基础知识 生信一百讲 1、 Ana...[作者空间]
文章：Temporal dynamics of gene expression and histone marks...[作者空间]
mRNA-seq是目前最常用的高通量测序技术，一般的用法就是看看基因表达谱，寻找差异表达的基因。我和高通量测序数据...[作者空间]
