挖掘公共单细胞数据集时，会遇到常见各种单细胞测序数据格式。现总结如下，方便自己日后调用，以创建Seurat对象（1...[作者空间]
1. 在同一张UMAP上展示细胞分群情况 问题：如果单独取出cluster再做dimplot,就会出现UMAP图坐...[作者空间]
1.FeaturePlot函数 FeaturePlot使用了split函数之后就没有legend了这个问题之前困扰...[作者空间]
1. Seurat对象查看当前的Assay 在进行了SCTransform操作后，矩阵默认会变成SCT矩阵，如果不...[作者空间]
ssGSEA即单样本GSEA分析，主要可以用来量化免疫浸润。 免疫浸润是什么？要是直白的解释就是免疫细胞渗透到肿瘤...[作者空间]
概述 细胞聚类：基于基因表达信息，将表达谱相近的细胞聚为一类，表达差别大的细胞彼此分开。 Seurat使用[作者空间]
一文了解单细胞对象数据结构/数据格式，单细胞数据操作不迷茫。本文内容包括 单细胞seurat对象数据结构， 内容构...[作者空间]
我在R中的stack和unstack函数[https://link.zhihu.com/?target=http%...[作者空间]
最近在分析单细胞数据，用DoHeatmap画热图的时候遇到一个问题，列标签（也就是每个细胞亚群的名字）出界了，在最...[作者空间]
质控 scRNA-seq数据中的低质量文库可能有多种来源，例如解离过程中的细胞损伤或文库制备失败（例如无效的逆转录...[作者空间]
问题 最近在做单细胞转录组亚群细分的时候，遇到了一个很意外的问题，那就是我之前做的结果，没有保存RDS文件，之...[作者空间]
