启动子及转录因子结合位点预测和转录终止信号预测
启动子Promoter是位于基因5'端上游的DNA序列，调控基因表达。作用方式是通过与转录因子结合。关于启动子更详细的简文请看[查找一个基因的启动子序列](https://www.jianshu.com/p/44b42a5bfbe0)
* 原核生物启动子区有明显的共同一致的序列，而真核基因启动子区域多种转录因子相互作用共同完成调控，调控机制更加复杂。
* 真核生物的启动子的-25~-35区域含有TATA序列，是RNA聚合酶的识别区，可以使转录精确起始，称为核心启动子元件
* 而-70<sub>-80区域含有CCAAT序列，-80</sub>-110区域有GCCACACCC或GGGCGGG序列，这两个区域控制转录的起始频率。
* TATA上游保守序列叫上游启动子元件（Upstream promoter element，UPE）或上游激活序列（Upstream activating sequence，UAS）。
* 真核有很多转录因子，同一个转录因子可以调控多个gene，转录因子结合的DNA序列是比较短的DNA片段，而在整个基因组又有大量重复序列，这些都给转录因子结合位点的识别带来难度。**所以，识别的时候要结合基因结构信息，如CpG岛，外显子/内含子信息等**
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