
ABcompartment和TAD主要采用cworld 软件进行分析。
Cworld 软件架构如下:


Cworld软件安装
https://github.com/dekkerlab/cworld-dekker

安装cworld 需要安装以下包:

步骤如下:
conda config --set always_yes yes --set changeps1 no
conda env create --name cworld --file cworld_environment.yml
conda clean --tarballs --index-cache --lock
source activate cworld
perl -MGD -e 'print $GD::VERSION ."\n";'
Cworld compartments 分析原理


Cworld compartments分析实例



使用实例:

结果解读:



网友评论