1. 关键：用矩形框住calibration bar后，右键duplicate
1. 主要步骤
I、先在recon image中生成一个合适大小的矩形roi（最好用macro生成）
一般使改roi垂直居中
I、Analyze->Tools->Calibration bar
在弹出的对话框的location选择At selection，不要勾选overlay(否则会破坏原图像)，设置合适的Number of labels（一般为3）和decimal（如果有小数，则设为0）。
II、这时会生成一幅RGB格式的包含Calibration bar的新图片
如果只需要灰度图像，则这时将图像格式改为灰度。
III、生成一幅与原图像等高的独立calibration bar图片
用macro(setpixel函数)把calibration bar矩形的上下的像素全改为白色，然后选一个与原图像等高的包含calibration bar的矩形roi，右键duplicate。
方法2：只框住calibration bar，右键duplicate。然后在PS中新建一个与原图像等高，calibration bar等宽的新图像，将calibration bar居中嵌入。注意，RGB格式的图像应设为8位，否则无法保存为eps格式。
2. Macro:recon指标尺，cali_bar_macro.txt
pixSize=256;whitePixelVal=255;
xStart=200;width=57;height=148;
yStart=(pixSize-height)/2;
xEnd=xStart+width;yEnd=(pixSize+height)/2;
makeRectangle(xStart, yStart, width, height);
run("Calibration Bar...", "location=[At Selection] fill=White label=Black //number=3 decimal=0 font=12 zoom=1");
run("32-bit");//change RGB to gray image
run("In [+]");
for(yInd=0;yInd<pixSize;yInd++)
{
for(xInd=xStart;xInd<pixSize;xInd++)
{
if(yInd<=yStart || yInd >=yEnd)
setPixel(xInd, yInd, whitePixelVal);
}
}
makeRectangle(xStart, 0, width-3, pixSize);
run("Duplicate...", " ");
3. Macro:bias指标尺bias_cali_bar_macro.txt
//Cali bar locates at the center
//size of cali image is 256 /times 256
pixSize=256;whitePixelVal=255;
width=57;height=148;
xStart=(pixSize-width)/2;yStart=(pixSize-height)/2;
xEnd=xStart+width;yEnd=(pixSize+height)/2;
makeRectangle(xStart, yStart, width-3, height);
run("Calibration Bar...", "location=[At Selection] fill=White label=Black //number=5 decimal=1 font=12 zoom=1");
run("32-bit");//change RGB to gray image
run("In [+]");
for(yInd=0;yInd<pixSize;yInd++)
{
for(xInd=xStart;xInd<xEnd;xInd++)
{
if(yInd<=yStart || yInd >=yEnd)
setPixel(xInd, yInd, whitePixelVal);
}
for(xInd=0;xInd<xStart;xInd++)
{
setPixel(xInd, yInd, whitePixelVal);
}
for(xInd=xEnd;xInd<pixSize;xInd++)
{
setPixel(xInd, yInd, whitePixelVal);
}
}
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