软件下载与编译tips 2020-12-10

以sratoolkit为例

对应系统下载 https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki/02.-Installing-SRA-Toolkit
http://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/current/sratoolkit.current-centos_linux64.tar.gz
tar -vxzf sratoolkit.tar.gz
解压后可直接使用

 11:21:12 /sratoolkit.2.10.8-centos_linux64
$ ll
总用量 64
drwxr-xr-x 3 NGB_OP 12288 6月  26 00:17 bin
-rw-r--r-- 1  NGB_OP 23052 6月  26 00:18 CHANGES
drwxr-xr-x 3  NGB_OP  4096 10月 12 2016 example
-rw-r--r-- 1 NGB_OP  5641 2月   3 2015 README-blastn
-rw-r--r-- 1  NGB_OP  2844 5月  16 2020 README.md
-rw-r--r-- 1 NGB_OP  4975 12月  5 2017 README-vdb-config
drwxr-xr-x 8 NGB_OP  4096 6月  26 00:04 schema

反之则需要makefile

 11:16:08 /sra-tools-2.10.8
$ ll
总用量 92
drwxr-xr-x  5  NGB_OP  4096 6月  30 00:30 build
-rw-r--r--  1 NGB_OP 27782 6月  30 00:30 CHANGES.md
-rwxr-xr-x  1  NGB_OP  1730 6月  30 00:30 configure
-rw-r--r--  1  NGB_OP  2848 6月  30 00:30 LICENSE
-rw-r--r--  1 NGB_OP  5330 6月  30 00:30 Makefile
-rw-r--r--  1  NGB_OP  5641 6月  30 00:30 README-blastn
-rw-r--r--  1 NGB_OP  2844 6月  30 00:30 README.md
-rw-r--r--  1  NGB_OP  4975 6月  30 00:30 README-vdb-config
drwxr-xr-x  2  NGB_OP  4096 6月  30 00:30 scripts
drwxr-xr-x  3  NGB_OP  4096 6月  30 00:30 setup
drwxr-xr-x  2  NGB_OP  4096 6月  30 00:30 shared
drwxr-xr-x 36  NGB_OP  4096 6月  30 00:30 test
drwxr-xr-x 51  NGB_OP  4096 6月  30 00:30 tools
drwxr-xr-x  4  NGB_OP  4096 6月  30 00:30 tools2