用来 查看 和 指定 改变下游分析所使用的
assay slot
1. 查看使用的 assay
DefaultAssay(Seurat_object)
2. 指定使用的 assay
DefaultAssay("RNA"): 正常单个样本分析
DefaultAssay("HTO"): 用HTO数据进行Cell hashing后的样本分类
DefaultAssay("integrated"): 对整合(两个或者以上样本)后的数据进行下游分析
用来 查看 和 指定 改变下游分析所使用的
assay slot
DefaultAssay(Seurat_object)
DefaultAssay("RNA"): 正常单个样本分析
DefaultAssay("HTO"): 用HTO数据进行Cell hashing后的样本分类
DefaultAssay("integrated"): 对整合(两个或者以上样本)后的数据进行下游分析
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本文参考Satija Lab的seurat 包，网址https://satijalab.org/seurat 设置...
本文标题：Seurat: DefaultAssay()
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/cjzomdtx.html
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