MEGA导出蛋白编码序列第1,2位密码子2021-01-24

1.准备一个密码子比对好的序列

>Aleochara_sp_1_Unclassified__KT780621
ATTCCACAAATAGCACCAATAAATTGATTAATATTGTTTTTAGTGTTTACATTAACTTTTCTTCTATTTAATAGAATAAATTTTTATTCATTTTTTTATACT---CCTAAGAAATTA---AATAAAATTAAAAAT------------------------------ATTAAATTAATAAATTGAAAATGA
>Aleochara_sp_2_Unclassified__KT780622
ATCCCTCAAATAGCACCTATAAATTGATTAACATTATTTTTCTTATTTATTGTAATCTTCATAATTTTTAATTCTATAAATTATTTTTCTTTTATATACAAT---ACTAAAATAACAACAAATATTAAAAAAAAT------------------------------AAAATTTTAACTAGCTGAAAATGA
>Aleochara_sp_3_Unclassified__KT780623
------------------------------------------------------------ATAAGTCGTAACATAGTAAATGTACTGGAAAGTGTATTTAGT---------------------------------------------------------------------------------------

2.使用MEGA打开选择分析模式

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3.选择核酸序列

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4.询问是不是编码蛋白序列，选择“是”
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5.选择序列物种类群密码子表，我选择的是5号无脊椎动物线粒体基因组密码子表。

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6.选择下图指示的图标查看序列
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7.选择Data导出数据
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8.选择导出格式，勾选的是导出保留的密码子。
比如导出文件只要1st和2nd那就只勾选Condon Positions中的1st和2nd。
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