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STOmicsDB升级助力科研数据共享|4步搞定空间组可视化数据

STOmicsDB升级助力科研数据共享|4步搞定空间组可视化数据

作者: 尐尐呅 | 来源:发表于2025-04-07 11:17 被阅读0次

正在为复杂数据分析焦虑、正手忙脚乱调整paper配图、正在为如何推广自己科研成果头疼的各位科研人

快来体验STOmicsDB新功能——可视化数据集!

在当今的生物学研究领域,数据可视化已经成为了科学家们不可或缺的“超级助手”。近日,时空组学数据库(STOmicsDB)全新上线数据可视化(Data Visualization)功能:支持研究人员创建自己的可视化数据集,其中可视化结果不仅满足文章发表的需求,同时还实现了数据的公开受控管理,促进数据共享和再利用。

时空组学数据库(STOmicsDB)

什么是可视化数据集?

可视化数据集是通过数据处理和分析,将复杂的生物学数据转化为直观的图形化展示形式的集合,它能帮助科研人员快速理解数据背后的生物学意义,发现那些隐藏的科学规律。

可视化数据集的展示结果可包含: 空间基因表达谱、细胞类型注释、统计分析结果、差异富集分析结果、细胞互作网络等。

为什么选择STOmicsDB

STOmicsDB 是一个综合性的空间组学数据库,其具有数据归档数据可视化两大核心功能,为时空组学研究提供“一站式”数据服务。

1. DIY高质量可视化数据集

支持如下可视化形式:

▸ 空间基因表达图谱(直观展示基因在空间中的表达分布)。

▸ 细胞类型注释(基于标记基因对细胞类型进行注释)。

▸ 细胞互作网络(揭示细胞间的显著交互关系)。

▸ 差异富集分析(识别不同细胞类型间的差异基因,并进行功能富集分析)。

2. 分析结果满足论文发表需求

提供标准化的分析和可视化结果,便于引用和展示。

3. 实现数据公开受控管理

支持如下数据公开与受控共享:

▸ 原始数据:未经处理的或质控过滤后的表达矩阵。

▸ 处理后的数据:标准化处理后的表达矩阵。

 自定义数据:用户提交的分析结果或注释。

4. 促进数据共享与再利用

通过标准化和可视化,提升数据的可用性和价值。

如何在STOmicsDB创建可视化数据集

STOmicsDB 提供了简单易用的可视化创建流程,4个关键步骤搞定可视化!小白也能轻松上手

1. 访问可视化创建界面

▸访问STOmicsDB官网,点击导航栏“Submission→Data Visualization“或首页Data Visualization→Submit按钮:

▸进入可视化创建界面

2. 开始新的可视化创建

▸点击 ”新建创建“,系统将生成一个唯一的创建编号(如 `stc0000xxx`):

3. 完成创建详细信息

▸提供其他信息

- 填写提交者姓名、项目名称等附加信息。

4. 可视化管理

▸在”创建列表界面“管理已创建的可视化。

▸对未完成的创建,可点击”修改“ 继续编辑,或点击”删除“ 移除。

▸对已完成的创建,可申请权限进行修改或删除。

| 本文供稿及审核:CNGBdb-马喜政

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