嘀嘀嘀,今天小编给大家介绍的是叶绿体注释工具CPGAVAS2的使用方法,觉得有用的盆友可以收藏起来。
使用方法
01 从NCBI数据库中寻找最佳参考基因组
1、进入NCBI官网:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/;
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2、进入页面后点击BLAST, 新页面出现后点击Nucleotide BLAST;
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3、在方框中输入序列的accession number或者提交序列文件后,点击左下角BLAST;
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4、出现这个页面之后请耐心等待,你提交的序列越长速度越慢;
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5、比对完成后出现下方页面,点击Evalue找到相似度最高的,点击相似度最高的结果对应的编号,下载对应的Genbank文件;
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6、点击这里查看下载的内容。
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02 开始注释
1、首先打开注释网站:
http://47.96.249.172:16019/analyzer/home
选择AnnoGenome;
image.png
2、出现下面页面,按照要求填写信息;
image.png
3、填写和上传完成后就可以提交了;
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4、提交完成后会出现如下界面,需要耐心等待10-20分钟左右;
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5、运行结束会出现如下界面;
image.png
6、下拉至这里点击下载;
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7、下载后解压即可。
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