2021 第二个周末，你在哪，还好吗？
这个周末的紫金山，虽不似上周那么冷，但是进阶俯首处见落黄满地，亦可感受到这深冬的寒意。依旧从钟灵街经体育学院上山，也许是因为天气冷，这周山上的人并不多。但可以看到一个人的沉静，两个人的温馨，三五个人的欢乐。
途中，一个妈妈对后面五六岁的孩子说：快点，不然跟不上我们了啊。一旁的爸爸补了一句：一会小狼闻到你的小鲜肉，就来找你了哦。孩子挥动着手中与自己一样高的树枝，自信满满地回道：我要~ 这铁棒有何用？我有~这变幻又如何？！真的是暖到了，再后面的爷爷补充的是：咱们家大圣要金猴奋起千钧棒，玉宇澄清万里埃了。要不怎么说南京是古都、文都呢？
这次虽然登上了头陀岭，依然没有停留，在上面点了一杯热姜茶就下山了。一个人的时候上山和下山都是比较快的，下山走的是九华山那一条，因为离地铁近。刚好在路上可以看到文都书店，这是南京获得文学之都后，在2020年12月22日揭牌成立的以南京文化为主的主题书店。由于下山较晚，到的时候，已经打烊休息，但是玻璃橱窗依然可以看到里面陈列的与南京有关的书籍。有机会可以到里面逛逛。
这周主要是读了Museum of Spatial Transcriptomics，这是一本讲空间转录组发展的在线书籍，对我们数据分析者来讲主要是其中分类列举了当前的分析方法与工具。这基本可以缓解目前空转分析中不知道都可以做什么的尴尬，这本书我觉得还是比较系统的。并写了：STRbook|| 纵论空间转录组前世今生作为书评，其实主要还是翻译书中的最后一节。
然后是写了
- 读《受体信号转导研究方法》
- 读《医学微生物组实战指南》|| 或一瞥单细胞数据分析
- 什么样的组织适合做空间转录组？
- SpatialExperiment || 空间数据管理
- 用ImageJ处理空间成像数据
- Seurat Weekly NO.07 || V4 新特性
- 空间转录组教程||用BayesSpace提高分群和基因分辨率
坦率地说，文章的发布是没有控制好的，应该留几篇以防不时之需。但是关于空转的内容还是有一篇发表一篇，本着空转研究负责的态度，其他的可以保留一段时间再发。如虽然也写了《m⁶A 研究一本通》和读《变量3》就留作补发材料了。
在地铁上，这周算是看完了《高级R语言编程指南》，虽然这不是第一次了。其实阅读高级的东西有一个不足之处就是，用的很少，所以不容易熟练掌握。就像R语言吧，其实一般的语法，程序基本就可以用来完成工作中的大部分问题了。进阶的语法学习成本高，应用场景少，但是一旦掌握了可以使工作效率翻倍，也可以解决一般人解决不了的问题。有计划写一写R语言编程的，找本书抄抄。本周也看了一些《数据科学中的并行计算：以R，C++和CUDA为例》，之前的并行都是小规模的，这本书可以说扩宽了我对并行的认识。
在长期的计划中是看了《癌生物学》的第七章<抑癌基因>和第八章<成视网膜母细胞瘤蛋白与细胞周期控制时钟>。大部分的内容可以在《细胞的分子生物学》中找到对应的知识点，这是说：癌细胞是利用细胞固有的机制来实现其无限增殖的。还有《基因X》，这几本厚的像砖头一样的书，翻看起来还挺有气势的。
然后是购买了
- 柳青的《创业史》
- 地理空间分析原理，技术与软件
- 癌症是代谢病
- 边缘奇迹：变相和临界现象
- R语言核心技术手册
- R语言在商务分析中的应用
家太小，买来都不知道放哪，愁。
好物是发现了一个分析TCR，BCR的python库：scirpy。看这名字就知道它是和scanpy一个体系的，易用性也是一样，很好用，就像R里面的scRepertoire可以和RNA数据结合到一起使用。
Scirpy: A Scanpy extension for analyzing single-cell T-cell receptor sequencing data
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