1.先提取最长转录本gff(conda install -c bioconda agat -y)
perl ~/miniconda3/bin/agat_sp_keep_longest_isoform.pl --gff A11.gff -o longest_isoforms.gff
2.基于最长转录本gff提取转录本序列
gffread longest_isoforms.gff -g A11_chr.fa -w longest_isoforms.fasta
1.先提取最长转录本gff(conda install -c bioconda agat -y)
perl ~/miniconda3/bin/agat_sp_keep_longest_isoform.pl --gff A11.gff -o longest_isoforms.gff
2.基于最长转录本gff提取转录本序列
gffread longest_isoforms.gff -g A11_chr.fa -w longest_isoforms.fasta
本文标题:2025-08-26提取最长转录本2
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