期刊：Cancer Cell
IF：48.8
发表时间：2024 Jul 8
文章简介：
本研究通过整合单细胞转录组、单细胞表观组、蛋白质组学和代谢组等组学，探索了高级别胶质瘤（HGG）的多尺度信号传导和肿瘤演变，揭示了上游异质性改变汇聚到下游共同事件的机制，强调了PTPN11信号在高级别胶质瘤中的核心作用。
样本策略：
200名患者（212个GBM和16个IDH突变4级星形细胞瘤）的228个肿瘤样本（包括28个复发肿瘤）以及18个正常大脑样本和14个脑转移样本，其中包括30例进行了单细胞测序的样本。
应用技术：
10x Genomics 3’scRNA-seq，10x Genomics Multiome，WES，WGS，蛋白质组、磷酸化蛋白质组和代谢组等。
研究亮点：
（1）揭示了代谢组和糖蛋白组数据中的驱动相互作用，并识别了肿瘤复发的潜在标记物。
（2）发现TERTp、PTEN或TERTp/EGFR的变异产生了相似的分子特征。
（3）PTPN11信号通路在HGG中扮演着关键角色，将EGFR、PDGFR和IDH1等信号通路联系到下游效应分子。
（4）异柠檬酸脱氢酶基因（IDH）突变的HGG具有较低的缺氧特征和降低的AMPKA活性。
研究意义：
这项研究在多层面扩展了我们对HGG肿瘤发展和演变的理解，并为开发新的治疗方法提供了潜在的靶点。
文献原文（DOI）：10.1016/j.ccell.2024.06.004
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