#需要用到的python包
import numpy as np
from prody import *
bc=np.loadtxt("bc.txt") #用文本文档格式储存一列想要展示的数据，这里是BC值
wt_aer=parsePDB("aer-wt-BC_as_bfactor.pdb") #读入PDB文件
wt_aer.setBetas(bc) #关键步骤，将想要展示的数据与PDB融合
writePDB('aer-wt-BC_as_bfactor.pdb', wt_aer) #输出PDB
将处理好的PDB导入PyMoL,设置spectrum为b-factor,如下图所示：
根据 b-factor设置颜色
此时的蛋白质结构：
使用脚本调整一下颜色的范围（这些颜色名称在Color栏中都可以找到）
spectrum b, blue cyan yellow tv_orange orange tv_red red
#需要用到的python包import numpy as npfrom prody import *bc=np.l...
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本文标题：PyMoL:使用b-factor将变量映射到蛋白质结构
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/gamgphtx.html
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