Linux环境下安装软件
Linux系统下的软件安装.png
下载软件
- 下载地址（应用商店）
conda 镜像站点——eg. 清华 mirror
在镜像站点进行相应的软件搜索，并复制下载链接地址以备在后面的Xshell操作中软件下载用。 - 如何下载
在xshell中运行命令——wget + 软件下载链接地址（注意粘贴时点击鼠标右键，不是
control+v）
eg. wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.shLinux-x86_64.sh
安装
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安装
在xshell中运行命令——bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -
激活——千万不能忘
在xshell中运行命令——source ~/.bashrc
注意：在安装的过程中出现问题，可删除文件后重新安装 - 添加镜像
运行命令 conda config --add channels +链接地址
运行软件
- 查看当前服务器上已安装的所有软件
在xshell中运行命令——conda list - 搜索软件
conda search fastqc
注：以数据质控软件fastqc为例 - 安装软件
在xshell中运行命令——conda install fastqc -y
也可以删除已装的软件——conda remove fastqc -y
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