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脚本更新--细胞类型、通路、TF、配受体共定位分析(visium

脚本更新--细胞类型、通路、TF、配受体共定位分析(visium

作者: 单细胞空间交响乐 | 来源:发表于2025-10-09 18:24 被阅读0次

作者,Evil Genius

今天我们来更新脚本,其实现在对于visium、华大bin > 50的数据分析而言,细胞类型共定位已经成了必须的分析内容了。

尤其在精细化亚群的空间共定位更加重要



随着分析的深入,扩展到细胞类型与生物学通路的共定位分析

直到我们2024年开始培训空间转录组的时候,进一步扩展到细胞类型、通路、TF、配受体共定位分析,视频链接在B站2024第九课:细胞类型共定位(细胞类型、TF、通路)


2025年培训重点讲了细胞类型的共定位

时至今日,这个分析我们需要更新了,24年的脚本已经不能跑了,需要进行脚本更新了,还是全流程脚本,python版本,实现细胞类型、通路、TF、配受体共定位分析。

全流程脚本如下

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