使用脚本:https://github.com/BioinfoUNIBA/QEdit
目录:
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参考流程:
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第一步:做ArteryTibial_vs_BrainCerebellum.sif文件
方法:利用sample_status_file_creator.py脚本
看脚本,输入文件需要至少四列,第四列为SRR号,第一列为分组
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输出文件:
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看样子,可以省略这步自己做输出文件就行。
文件做出之后需要先挪redi结果,位置在../tables,是他程序写死的位置,不灵活。之后就是DE,这里报错不能有Un为chr。看来还需要先做小文件试一试。
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测试小的:
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删除62的Un
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63 65 66 都删了
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