学习内容

1 Linux简介

Linux是一个基于 POSIX 和 UNIX 的多用户、多任务、支持多线程和多 CPU 的操作系统，与Windows和Mac一样。

2 Linux与生信

Linux通过强大的命令执行功能，可以实现快速、批量、灵活的处理数据的提取、统计和整理等耗时耗力的重复性工作。

3 Linux登录（Mac)

Mac自带的ubuntu即可直接登录使用，无需下载安装PuTTy。

4 Linux基本操作

4.1 pwd（print working directory）显示当前路径

屏幕快照 2020-04-18 下午12.18.03.png

4.2 mkdir: make directory,创建空目录

mkdir biosoft 存放生信软件
mkdir project 存放项目
mkdir src 存放杂乱
mkdir tmp 存放源代码

屏幕快照 2020-04-18 下午12.29.28.png

4.3 ls 显示所有列表，包括目录和文件

屏幕快照 2020-04-18 下午12.32.34.png

4.4 rm删除目录或者文件

rm: 文件
rmdir:空目录
rm-r: 非空目录

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4.5 cd 返回根目录

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4.6 vi 新建脚本或者文本文档(vi是linux中的文本编辑器）

输入vi后回车出现的"VIM", 一些vi基本命令如下：
i (insert) 输入
Esc 退出编辑模式，输入以下命令：
:wq 保存后退出vi，若为 :wq! 则为强制储存后退出（常用）
:w 保存但不退出（常用）
:w! 若文件属性为『只读』时，强制写入该档案
:q 离开 vi （常用）
:q! 曾修改过档案，又不想储存，使用 ! 为强制离开不储存档案。
:e! 将档案还原到最原始的状态！

4.7 cat:查看并直接将内容输出到屏幕

head #输出前10行
tail #输出后10行
后面加上-n自定义输出几行,
例如：head -n 3 hello_world.txt 【注意-n与head之间有空格，-n和3之间空格可有可无】

4.8 cp 复制文件

使用cp file1 file2

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4.9 mv 将文件移入文件夹或重命名

使用 mv file 路径

附加题：1 长格式列表

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附思维导图一张

54期生信学习小组Day2-Ju Chen.png