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高精度空转（Xenium、CosMx等）细胞邻域通讯分析的实现

高精度空转（Xenium、CosMx等）细胞邻域通讯分析的实现

作者: 单细胞空间交响乐 | 来源:发表于2025-08-24 16:32 被阅读0次

作者，Evil Genius

最近有一些粉丝问王凌华的文献下面的分析如何实现的

其实关于高精度的空转平台，项目并不多，但是每一个都是合作项目。

王凌华的文章详细梳理过，也是2025单细胞空间课程的重点文章，目前2025单细胞空间培训培训的全部视频我已经上传到B站，链接在2025年单细胞空间系列课程

那么回到这个问题，其实分析思路并不复杂，文章也给出了详细的方法

总计一下就是

1、识别目标细胞的亚群（这是25培训第24课的内容）
2、提取亚群周围的细胞类型组成(一定范围内)
3、进行细胞通讯分析。

第一步之前分享过了，在课前准备---依据微环境识别细胞亚型

我们来实现第二步和第三步(python代码),其实实现了第二步，后续大家想用哪个软件做细胞通讯都是可以的。

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      本文标题：高精度空转（Xenium、CosMx等）细胞邻域通讯分析的实现

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