R中的小技巧

作者: 生信编程日常 | 来源:发表于2020-01-14 20:09 被阅读0次
  1. str()
    在很多语言里可以将其他类型转化为字符串,不过在R中会返回数据类型。
data(iris)
str(iris)

返回:
'data.frame': 100 obs. of 5 variables:
$ Sepal.Length: num 7 6.4 6.9 5.5 6.5 5.7 6.3 4.9 6.6 5.2 ...
$ Sepal.Width : num 3.2 3.2 3.1 2.3 2.8 2.8 3.3 2.4 2.9 2.7 ...
$ Petal.Length: num 4.7 4.5 4.9 4 4.6 4.5 4.7 3.3 4.6 3.9 ...
$ Petal.Width : num 1.4 1.5 1.5 1.3 1.5 1.3 1.6 1 1.3 1.4 ...
$ Species : Factor w/ 2 levels "versicolor","virginica": 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...

  1. 通过链接读取数据
site <- "http://random.org/integers/"  # 这是一个生成随机数的网站
# 产生两列10行随机数,最小值100,最大值200
query <- "num=10&min=100&max=200&col=2&base=10&format=plain&rnd=new"
txt <- paste(site, query, sep="?") # 网址
nums <- read.table(file=txt) # 读取
  1. 反引号
df <- data.frame(x=rnorm(5),y=runif(5))
names(df) <- 1:2

取第一列,如果是这样则会报错:

df$1

报一个“错误: unexpected numeric constant in "df$1"”的错误。

但是这样可以:

df$`1`

df$后tab键提示出来也是会有反引号的。

做线性回归也可以:

lm(`2`~`1`,data=df)
  1. 对数据框的操作

新建数据:

sales <- expand.grid(country = c('USA', 'UK', 'FR'),
                     product = c(1, 2, 3))
sales$revenue <- rnorm(dim(sales)[1], mean=100, sd=10)

transform增加列:

usd2eur <- 1.5
transform(sales, euro = revenue * usd2eur)
  1. cut / table
    cut可以把数据分成想要的区间:
irisSL <- iris$Sepal.Length
# 分成五个bins
cut(irisSL, 5)
# 也可以按我们想要的范围分割
cut(irisSL, breaks = seq(1,8,1))

可以用table统计每个范围的数目:

table(cut(irisSL, 5))

返回:
(4.9,5.5] (5.5,6.1] (6.1,6.7] (6.7,7.3] (7.3,7.9]
12 33 35 13 7

欢迎关注~


生信编程日常

相关文章

  • R中的小技巧

    str()在很多语言里可以将其他类型转化为字符串,不过在R中会返回数据类型。 返回:'data.frame': ...

  • R 小技巧

    R Warning of Tool-global option-32bit WARNING: You are co...

  • R | 小技巧

    使用R有一段时间,如今开始系统性归纳此前所学,亦当深化记忆。 R studio R studio是R的一种编译环境...

  • R|小技巧

    1.默认加载包[#%E9%BB%98%E8%AE%A4%E5%8A%A0%E8%BD%BD%E5%8C%85] 如...

  • R小技巧

  • 【R】R语言使用小的技巧

    1. 内存管理 memory.size(T)查看已分配内存 memory.size(F)查看已使用内存 memor...

  • [R|小技巧]在Rstudio中折叠R代码块

    众所周知,在Rstudio中把R代码编辑成函数的时候,会出现一个小下三角。可以用于把函数代码折叠起来。方便区块化的...

  • R语言小技巧

    当一个探针对应多个基因名时,取第一个 当多个探针对应一个基因名时,取平均值 按照某个字段的某些字符串进行分组 取在...

  • R语言 小技巧

    ?Startup **可以编辑每次刚打开Rstudio时显示在console里的提示语/欢迎语,或在每次打开/关闭...

  • 美化R图片小技巧

    1. 将图片导出为PDF格式,使用Adobe Illustrator打开,即可编辑图中文字部分。 2. eoffi...

网友评论

    本文标题:R中的小技巧

    本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/imsaactx.html