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思路清奇SCI:07.糖酵解基因+ccRCC(4+分）

思路清奇SCI:07.糖酵解基因+ccRCC(4+分）

作者: 高大石头 | 来源:发表于2021-04-15 00:18 被阅读0次
糖酵解相关基因
PMID:33816274
杂志：Frontiers in Oncology

背景

作者通过对正常/癌旁与肿瘤组织进行GSEA分析发现5个糖酵解相关通路（glycolysis）在肾透明细胞癌（ccRCC）中都有显著差异，因此作者想研究下糖酵解相关基因对ccRCC的影响。

结果

1.GSEA+差异分析

  • 作者选取5个糖酵解相关通路，以FDR < 0.25 作为阈值，表明ccRCC确实与糖酵解有关。
  • 288糖酵解相关基因→差异分析→unicox+PPI
Fig 2
Fig 3

2.模型构建

Fig 4
Fig 5
Fig 6

3.模型验证

  • 收集78例ccRCC病例验证


    Fig 8

  • GSE22541验证


    Fig 9

4.模型周边-药物敏感性和免疫反应性

作者用 E-MTAB-3267（53例）和 E-MTAB-3218（59例）直接验证模型对药物敏感和免疫治疗的反应性，这点非常值得借鉴。

Fig 10

感悟

通过真实检测队列查看模型对药物敏感性和免疫治疗的反应性，值得借鉴。

参考链接：
Identification of a Novel Glycolysis-Related Gene Signature Correlates With the Prognosis and Therapeutic Responses in Patients With Clear Cell Renal Cell Carcinoma

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