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7.腹主动脉瘤及动脉闭塞性疾病的数据挖掘

7.腹主动脉瘤及动脉闭塞性疾病的数据挖掘

作者: D2聚体 | 来源:发表于2019-07-31 03:58 被阅读0次
题目:Differential gene expression in human aneurysm and aortic occlusive disease
DOI: https://doi.org/10.18632/oncotarget.3848
数据集: GSE57691
样本:

small AAA: 20
big AAA:29
AOD: 9
control: 10

分析方法:

DEG: GeneSpring GX version 11.5.1 (≥ 2.0-fold, adjusted P < 0.05)
DAVID: GO和KEGG富集分析
PCR/IHC:验证关键基因

文章数据:

1.韦恩图展示各组的差异基因数量


  1. IHC验证CD8+淋巴细胞及CTLA4在big AAA中高表达


3.进行测序的临床样本病人信息


4.在大、小AAA中Top10富集通路


5.在AAA中与免疫相关的差异基因


6.AOD中的top10富集通路


7.AOD中的差异基因


8.PCR验证AAA或AOD中的差异基因



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