这个服务器上没有bgzip这个命令,我使用conda进行安装
conda install tabix
这个安装的是 0.2.6版本
解压
bgzip -d pacbio.sequel.fastq.gz
遇到报错
Error: 2
然后我卸载,重新安装0.2.5试一下
conda uninstall tabix
conda install tabix=0.2.5
再次解压遇到报错
Error: invalid block header
以上报错不知道什么原因,搜索一番后看到有人说安装好 htslib后就可以直接使用bgzip了。
我试了一下
conda uninstall tabix
conda install htslib
果然这次再用bgzip解压就没有报错了
什么原因还是不知道,现在暂时可以用了
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