作者,Evil Genius
当初上研究生的时候,导师讲过,抄一篇文章那叫抄袭,抄10篇写成的文章叫总结,抄100篇写成的文章那叫创新。
大家学习生信代码也是一样的,只借鉴一处的代码那叫照搬,没多大用,借鉴10处的代码汇总那叫总结,可以运用,搜集几十上百处的代码总结出来优劣势并且扬长避短也是创新,这个时候分析自己的数据,那高分文章,数据分析这块儿就不是短板了。
大家应该看过有一些高分文章,就是总结各个软件的优劣势,比如细胞轨迹,通讯,单细胞空间联合等等。
今日目标
我们需要分三步完成
第一步:细胞类型的hotspot
第二步:通路的hotspot
第三步:配受体的hotspot
第一步,我们需要寻找细胞类型的hotspot,一般就是运用SpottedPy,链接在GitHub - secrierlab/SpottedPy: Hotspot cluster distance analysis in spatial transcriptomic data,大家多多学习。
我们需要实现多样本,多细胞类型hotspot的数据分析,并且进行距离分析











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