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物种数据转换

物种数据转换

作者: 肖ano | 来源:发表于2020-09-24 13:58 被阅读0次

转换思想

接触到16s微生物测序数据的分析,微生物公司给的分析方法是先进行log1p转换,参考Borcard et., al 老爷子的说法,还是可采取的。



转化方法

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转化方法

关联度测



Reference:
Borcard D, Gillet F, Legendre P. Numerical ecology with R[M]. Springer, 2018.
Jari Oksanen, F. Guillaume Blanchet, Michael Friendly, Roeland Kindt, Pierre Legendre, Dan McGlinn, Peter R. Minchin, R. B. O'Hara, Gavin L. Simpson, Peter Solymos, M. Henry H. Stevens, Eduard Szoecs and Helene Wagner (2019). vegan: Community Ecology Package. R package version 2.5-6. https://CRAN.R-project.org/package=vegan

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