多个扩增子交叉设计可能存在突变漏检情况
测试工具:vardict amplicon 模式
Filter 标签 在交叉区域的突变存在 “AMPbias” ,在不同扩增子中表现不同。
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扩增子测序数据分析 fq.gz --- >vcf fq1=2fq1_clean=4sample=$5adapte...
扩增子一站式分析平台QIIME nature||qiime 2018年1月QIIME2全面接档QIIME1 极简操...
一、研究背景 扩增子测序是分析微生物组成熟且成本较低的方法。然而,扩增子数据处理需要生物信息学技能和高计算能力来处...
16s rDNA普遍存在于原核生物中,在生物进化中保持不变; 具有高度保守序列,又有中度保守和高度变化的序列区域,...
质控 拼接 join_paired_ends.py -f 1_1.fq.gz -r 2_2.fq.gz -m f...
在上期内容中,我们介绍了升级后的扩增子分析结果中的差异分析和环境因子关联分析,今天继续来了解其他的分析内容吧! 一...
phyloseq: 扩增子统计分析利器 phyloseq包对多类型数据的综合软件,并其对这些数据提供统计分析和可视...
本文标题:扩增子分析2
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