cut

cut以行为处理单位，提取指定区域数据。

1. cut -bn <file>,以字节（byte）为分割单位
   -b list 打印出list中指定位置字节，制表符和空格符均为一个字节；
   -n 对于多字节字符不进行分割，主要针对汉字（一个汉字三个字节）等多字节字符；
2. cut -c <file>,以字符（character）为分割单位
   -c list 打印出list中指定位置字符，对于单字节字符同-b选项，对于多字节字符有区别；
3. cut -df <file>,以域（field）为分割单位
   -f list 指定取出哪一列，默认以制表符作为分隔符;
   -d byte 指定分隔符;

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sed

stream editor,以行为单位，每处理完一行立即打印，再处理下一行。

1. sed [options] 'command' filename
   options是指sed的命令行参数，sed从filename标准输入。如果操作比较复杂，为了简便，可以把命令写到script，然后-f参数调用。
2. sed -f sed_script filename
   sed_script是指对输入执行的一个或多个命令，sed会依次读取输入文件的每一行操作指令并做相应处理.
   3.d删除行
   sed '2,4d' filename #删除第2到第4行
3. s查找替换

sed 's/RNA/DNA/' filename  #s默认只替换每一行第一次匹配到的内容
sed 's/RNA/DNA/n' filename  #替换每一行第n个匹配值
sed 's/RNA/DNA/g' filename  #利用g选项，表示全局匹配，替换所有能够匹配到的值
sed 's/RNA//g' filename  #将RNA替换成空，即删除所有RNA

4. y字符替换

sed 'y/RNA/WD/' filename  #如果前后对应的字符数不一致则会报错。
sed 'y/RNA/WDY/' filename #将R替换成W，N替换成D，A替换成Y
sed 'y/01234/ABCDE/' filename #将0替换成A，将1替换成2…… 

5. a/i插入命令

sed '3 i line' filename  # i表示在3行之前插入
sed '3 a LINE' filename  # a表示在3行之后插入

6. n命令读取下一行，用下一个命令处理新的行
   n命令是两行为一个单位进行处理的，其中第一行为匹配行而非处理行
   sed '/1#/ {n; s/RNA/DNA/g}' filename
   首先匹配1即第1行，然后替换命令处理下一行即第2行
7. ;一次执行多个命令
   sed 's/RNA/DNA/g; y/12345/ABCDE/' filename
8. &保存搜索字符用来替换其他字符

sed 's/RNA/&AA/g' filename  #在RNA后添加AA
sed '/RNA/ {s//&AA/g}' filename  #作用同上

9. q命令退出
   sed '2q' filename #打印前2行后退出

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