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脚本优化--visium的细胞niche与共定位(python版

脚本优化--visium的细胞niche与共定位(python版

作者: 单细胞空间交响乐 | 来源:发表于2025-10-29 10:13 被阅读0次

作者,Evil Genius

今天我们继续更新脚本。

昨天的文章中提到了我们针对单细胞空间联合分析的矩阵要进行ilr转换,但是我们通常的单细胞空间联合采用的是cell2location,所以我们需要更新python脚本,直接对接cell2location,python实现ilr转换。

2025番外--linux、R、python培训, 这是所有将来从事生物信息行业的第一课,也是参加工作的必备技能。

完整脚本如下

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