用multiqc工具整合多个fastqc的结果

作者: 小明的数据分析笔记本 | 来源:发表于2022-02-01 07:26 被阅读0次

用multiqc工具整合多个fastqc的结果
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我的fastqc结果输出

image.png

查找当前目录下所有的.zip结尾的文件，将结果输出到一个文件里

find ./ -name "*.zip" > file.list

新建一个文件夹保存multiqc的输出结果

mkdir multiqc.output

运行multiqc

multiqc --file-list file.list -o multiqc.output

image.png

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