细胞器基因组组装：
细胞器序列去除：
将细胞器基因组比对至组装版本基因组，对比对结果过滤。过滤条件可以为比对coverage 及比对长度，对达到比对长度和coverage的序列去除，对达到比对达到比对长度但未达到coverage的序列的比对上部分从基因组中移除。
如果没有该基因组细胞器序列，需要先组装细胞器序列，再比对去除 如果有了该基因组的细胞器基因组（如公开数据库可获取）...
与核基因组相比，细胞器基因组相对来说，更为保守，并且序列较短，更加易于组装，仅仅根据二代测序reads即可进行组装...
转录组组装软件 基因组组装 基因组组装（Genome assembly）是指使用测序方法将待测物种的基因组生成序列...
quickmerge是一个用来去除基因组组装中的重复的软件。 该软件没有单独的文章，是作为某个基因组组装中的衍生脚...
组装结果统计 下面对组装得到fasta 格式基因组序列进行长度、N50 等统计。 使用assembly-stats...
1. 组装基因组质控 得到组装好的基因组序列之后，首先要使用多种方法评估组装质量。这里用到2款可用于基因组组装质量...
1.基因组组装的流程 基因组组装的大概流程如下： (1) 测序得到raw reads序列。 (2) Reads质量...
在组装完成细胞器基因组之后，需要对基因进行注释。 推荐的网站有： Geseq：https://chlorobox....
对于宏基因组测序,我们不可避免的会在DNA提取中引入宿主基因组序列,为了避免这些序列的干扰,在进行分析和组装之前,...
宏基因组复杂样品基因组的组装（无参考基因组） 什么是Gap以及它是怎样产生的 Gap ： 序列中未确定的区域，通常...
本文标题：基因组组装结果中去除细胞器序列
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/mdusgftx.html
网友评论