sra转fastq

作者: kke_wang | 来源:发表于2020-07-14 00:31 被阅读0次

1.安装好软件之后（fastq-dump)使用代码

ls ./* | while read id;do (nohup fastq-dump --gzip --split-3 -O ./ ${id} &); done

就能将sra文件转换为fastq文件

单细胞SRR数据拆分
10X单细胞转录组测序数据的 SRA转fastq fastq-dump SRA转fastq 参考链接：10X单细胞...
sra转fastq
1.安装好软件之后（fastq-dump)使用代码就能将sra文件转换为fastq文件
将SRA转为fastq,fastq-dump
fastq-dump --gzip --split-files SRR10096826.1.sra fastq-d...
2019-11-08
.sra 格式变为 .fastq nohup fastq-dump --split-3 SRR7881539.sr...
转录组分析笔记（4）质量控制
fastq-dump将sra数据转换成fastq格式for ((i=59;i<=62;i++));do fastq...
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