VCF文件参数解读

相关文章

• 

  VCF文件参数解读

  VCF (variant callformat) 文件记录了所有样品基因组中所有位置变异（主要包括SNP和InDe...

• 

  2021-06-30vcftools的相关参数和使用

  1.vcftools是一种可以对VCF文件和BCF文件进行格式转换及过滤的工具。 2.输入参数 –vcf 支持...

• 

  VCF格式文件解读(转)

  1，vcf格式说明 VCF格式：Variant Call Format，用于记录variants (SNP / I...

• 

  课题步骤记录

  拿到 raw vcf 文件

• 二、Zookeeper安装

  2.1 本地模式安装部署 2.2 配置参数解读 Zookeeper中的配置文件zoo.cfg中参数含义解读如下： ...

• annovar注释除人类以外SNP

  快速注释已经得到的vcf文件 所需文件 ref.fa gff3文件或者gtf vcf文件 简单流程 1.建立一文件...

• gwas分析时数据格式转换

  排序 从vcf文件排序开始，可以使用picard，也可以使用vcftools 的vcf-sort vcf转换为pe...

• 2019-07-26用EIGENSOFT的smartpca进行主

  1.vcftools或plink进行文件格式转换 vcftools --vcf myfile.vcf --plin...

• 

  Genetype类型

  对VCF文件中GT类型的记录：

• 

  单行命令

  根据id提取vcf（提取重测序数据不会有日志等啰嗦行） 根据染色体提取vcf 根据位置提取vcf（pos文件含染色...