续昨
按示例数据选取前6个基因，一般实验中选取marker基因：
6geneplot.png
6plot.png
t-distributed stochastic neighbour embedding (t-SNE)
multiplot.png
PCAplot.png
plateplot.png
Trf-gplot.png
Trfplot.png
Trf-sizeplot.png
tsneplot.png
tsne-Trfplot.png
数据图不好看，主要是为了理解流程走代码
刘小泽写于19.4.4+4.7结合一篇文章+scater说明书，并做了一些个人修改 首先上文章和scater包说明...
scater包简介 scater是一个优秀的单细胞转录组数据分析工具包，它可以对单细胞数据进行常规的质量控制，数据...
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这里是佳奥，我们继续复现文章数据。 1 scater Package 2 monocle Package 参考代码...
这里是佳奥！我们继续学习最重要的三个R包。 1 scater Package(calculateQCMetrics...
三大软件 1. Seurat 2. Scran 3. scater 可视化而已 Seurat 归一化的方法是： I...
我一直强调过，所谓的单细胞数据分析，其实就5个R包，分别是: scater,monocle,Seurat,scra...
本次教程学习使用scater包进行单细胞转录组数据降维与常用的一些可视化方法。plotExpression: pl...
本文标题：scRNA---Day8(scater)
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